基因页:PPP1R14D
概括?
基因 | 54866 |
象征 | PPP1R14D |
同义词 | cpi17 like | gbpi-1 | gbpi1 |
描述 | 蛋白质磷酸酶1调节抑制剂亚基14d |
参考 | MIM:613256|HGNC:HGNC:14953|ENSEMBL:ENSG00000166143|HPRD:17891|Vega:Otthumg00000130064 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 15Q15.1 |
Pascal P值 | 0.229 |
胎儿β | -0.076 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PPP1R14D | CHR15 | 41107855 | C | t | NM_001130143 NM_017726 |
p.198g> d 。 |
错过 3-UTR |
精神分裂症 | DNM:XU_2012 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PPP1R14D_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Kank1 | 0.82 | 0.79 |
CGNL1 | 0.81 | 0.85 |
sash1 | 0.81 | 0.83 |
TNS1 | 0.80 | 0.88 |
FYCO1 | 0.79 | 0.85 |
TJP2 | 0.79 | 0.82 |
TLN1 | 0.78 | 0.82 |
SSFA2 | 0.78 | 0.79 |
TJP1 | 0.78 | 0.80 |
预告片 | 0.76 | 0.79 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Znf32 | -0.56 | -0.71 |
SCNM1 | -0.56 | -0.67 |
Med19 | -0.55 | -0.61 |
Commd3 | -0.54 | -0.66 |
DCTN3 | -0.53 | -0.60 |
C18orf21 | -0.52 | -0.62 |
NR2C2AP | -0.52 | -0.60 |
polb | -0.51 | -0.62 |
C12orf73 | -0.51 | -0.58 |
ALKBH2 | -0.51 | -0.61 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vmyb vs cmyb的刘目标 | 20 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU HGF靶向Akt1 DN抑制 | 95 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向DN | 211 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |