概括
基因 54866
象征 PPP1R14D
同义词 cpi17 like | gbpi-1 | gbpi1
描述 蛋白质磷酸酶1调节抑制剂亚基14d
参考 MIM:613256|HGNC:HGNC:14953|ENSEMBL:ENSG00000166143|HPRD:17891|Vega:Otthumg00000130064
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q15.1
Pascal P值 0.229
胎儿β -0.076
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:XU_2012 整个外显子组测序分析 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
PPP1R14D CHR15 41107855 C t NM_001130143
NM_017726
p.198g> d
错过
3-UTR
精神分裂症 DNM:XU_2012


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Kank1 0.82 0.79
CGNL1 0.81 0.85
sash1 0.81 0.83
TNS1 0.80 0.88
FYCO1 0.79 0.85
TJP2 0.79 0.82
TLN1 0.78 0.82
SSFA2 0.78 0.79
TJP1 0.78 0.80
预告片 0.76 0.79
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Znf32 -0.56 -0.71
SCNM1 -0.56 -0.67
Med19 -0.55 -0.61
Commd3 -0.54 -0.66
DCTN3 -0.53 -0.60
C18orf21 -0.52 -0.62
NR2C2AP -0.52 -0.60
polb -0.51 -0.62
C12orf73 -0.51 -0.58
ALKBH2 -0.51 -0.61

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vmyb vs cmyb的刘目标 20 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU HGF靶向Akt1 DN抑制 95 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向DN 211 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因