基因页：ST7L
概括？
| 基因 | 54879 |
| 象征 | ST7L |
| 同义词 | FAM4B | ST7R | STLR |
| 描述 | 抑制肿瘤性7 |
| 参考 | HGNC：HGNC：18441|ENSEMBL：ENSG00000007341|HPRD：18112|Vega：Otthumg00000011753 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1p13.2 |
| Pascal P值 | 1.635E-4 |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0235 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS5777126 | 1 | 113096840 | ST7L | ENSG00000007341.14 | 1.45367E-6 | 0.02 | 66607 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| traf2 | 0.88 | 0.90 |
| STK11 | 0.87 | 0.88 |
| LONP1 | 0.87 | 0.88 |
| MAD1L1 | 0.86 | 0.89 |
| CTBP1 | 0.86 | 0.89 |
| mier2 | 0.86 | 0.88 |
| ranbp3 | 0.86 | 0.88 |
| LRRC4B | 0.86 | 0.89 |
| pank4 | 0.86 | 0.87 |
| 纳德 | 0.86 | 0.87 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.72 | -0.73 |
| AF347015.21 | -0.71 | -0.77 |
| MT-CO2 | -0.70 | -0.72 |
| AF347015.33 | -0.68 | -0.70 |
| AF347015.8 | -0.67 | -0.71 |
| AF347015.27 | -0.67 | -0.72 |
| mt-cyb | -0.66 | -0.69 |
| AF347015.2 | -0.64 | -0.67 |
| AF347015.15 | -0.63 | -0.68 |
| higd1b | -0.62 | -0.66 |
第三节。基因本体论注释
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Wamunyokoli卵巢癌LMP DN | 199 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼头颈癌E | 89 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CERVERA SDHB靶向1个 | 118 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Korkola胚胎癌与精液瘤DN | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-135 | 1783年 | 1789年 | M8 | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
| HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
| mir-185 | 1533年 | 1540年 | 1A，M8 | HSA-MIR-185脑 | Uggagaaaggcaguuc |