基因页：RNF43
概括？
| 基因 | 54894 |
| 象征 | RNF43 |
| 同义词 | RNF124 | URCC |
| 描述 | 环手指蛋白43 |
| 参考 | MIM：612482|HGNC：HGNC：18505|ENSEMBL：ENSG00000108375|HPRD：07896|Vega：Otthumg00000179077 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17q22 |
| Pascal P值 | 0.006 |
| Sherlock P值 | 0.046 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | RNF43 | 54894 | 3.556e-5 | 反式 | ||
| RS16841750 | CHR2 | 158288461 | RNF43 | 54894 | 0.16 | 反式 | ||
| RS7584986 | CHR2 | 184111432 | RNF43 | 54894 | 0.11 | 反式 | ||
| RS7306102 | CHR12 | 24607037 | RNF43 | 54894 | 0.11 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | RNF43 | 54894 | 2.316E-8 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Kitlg | 0.88 | 0.47 |
| LHX9 | 0.86 | 0.25 |
| epha1 | 0.85 | 0.31 |
| slitrk6 | 0.84 | 0.48 |
| GBX2 | 0.83 | 0.32 |
| ano2 | 0.82 | 0.52 |
| FOXP2 | 0.81 | 0.37 |
| KRT18P19 | 0.81 | 0.19 |
| fign | 0.80 | 0.47 |
| PDE5A | 0.80 | 0.43 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Cidea | -0.20 | -0.15 |
| KIAA1614 | -0.20 | -0.04 |
| S100A1 | -0.19 | -0.08 |
| AF347015.33 | -0.19 | -0.18 |
| AC018755.7 | -0.19 | -0.10 |
| EMX1 | -0.19 | -0.12 |
| 个人电脑 | -0.19 | -0.09 |
| AF347015.2 | -0.19 | -0.17 |
| AIF1L | -0.18 | -0.10 |
| MT-CO2 | -0.18 | -0.14 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID P73Pathway | 79 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| chathafe乳腺癌基础与间充质 | 121 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗伊伤口血管DN | 22 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺夫在结肠癌中突变 | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 农民乳腺癌基础与仙女 | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标 | 126 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标 | 212 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤C DN | 59 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boyault肝癌子类G6 UP | 65 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤PCA3 | 80 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤 | 207 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BHAT ESR1不是通过AKT1 DN的目标 | 88 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 农民乳腺癌簇5 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |