基因页：elovl2
概括？
| 基因 | 54898 |
| 象征 | elovl2 |
| 同义词 | SSC2 |
| 描述 | Elovl脂肪酸延伸酶2 |
| 参考 | MIM：611814|HGNC：HGNC：14416|Ensembl：ENSG00000197977|HPRD：16857|Vega：Otthumg0000000014252 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p24.2 |
| Pascal P值 | 0.462 |
| 胎儿β | 1.264 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0159 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7132043 | CHR12 | 80968399 | elovl2 | 54898 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FBXL15 | 0.85 | 0.82 |
| PCSK1N | 0.83 | 0.80 |
| MRPS12 | 0.83 | 0.79 |
| MRPL4 | 0.83 | 0.81 |
| DGCR6L | 0.83 | 0.78 |
| B3GAT3 | 0.82 | 0.83 |
| C16orf13 | 0.81 | 0.78 |
| ZNF771 | 0.80 | 0.76 |
| ATP5D | 0.80 | 0.78 |
| MRPL38 | 0.80 | 0.79 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-ATP8 | -0.35 | -0.24 |
| SEC62 | -0.33 | -0.38 |
| EIF5B | -0.33 | -0.41 |
| AF347015.18 | -0.32 | -0.19 |
| RBM25 | -0.31 | -0.25 |
| SFRS12 | -0.30 | -0.26 |
| AF347015.8 | -0.29 | -0.18 |
| AF347015.2 | -0.29 | -0.16 |
| mt-cyb | -0.29 | -0.19 |
| AF347015.26 | -0.27 | -0.16 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO：0016747 | 转移酶活性，氨基酰基基团以外的其他酰基基团 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000038 | 非常长的链脂肪酸代谢过程 | IEA | - | |
| 去：0006633 | 脂肪酸生物合成过程 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005792 | 微型体 | IEA | - | |
| 去：0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
| 去：0005783 | 内质网 | IEA | - | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 不饱和脂肪酸的KEGG生物合成 | 22 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组甘油三酸酯的生物合成 | 38 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Alpha亚麻酸ALA代谢 | 12 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Fatty Acyl COA生物合成 | 18 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 | 168 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组合成非常长的链脂肪酰基COA | 14 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Doane乳腺癌ESR1 UP | 112 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 农民乳腺癌根源与腔内 | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| liang造血细胞数量大与微小 | 44 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 贝克莫昔芬抵抗DN | 52 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN | 163 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Affar YY1目标 | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 大脑衰老 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU GH1自分泌目标DN | 142 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性4 | 307 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Riggins他莫昔芬抵抗DN | 220 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kondo EZH2目标 | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh他莫昔芬抵抗DN | 258 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh对雌二醇的反应 | 61 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 华莱士前列腺癌竞赛 | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Masri对他莫昔芬和芳香酶抑制剂的耐药性向上 | 20 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肝脏DN中的Smid乳腺癌复发 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌腔 | 84 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TGFB1和WNT3A的LABBE目标 | 111 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ichiba移植与宿主疾病D7 DN | 40 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ichiba移植与宿主疾病35D DN | 49 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标60小时DN | 277 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌生存 | 73 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verhaak胶质母细胞瘤经典 | 162 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标增长 | 243 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dutertre雌二醇反应24小时 | 324 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMAD1和SMAD5 DN抑制Pangas肿瘤 | 157 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Servitja Islet HNF1A靶向DN | 109 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB2同工4的PEDERSEN转移4 | 110 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124.1 | 2322 | 2328 | 1a | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| mir-135 | 2952 | 2958 | M8 | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
| HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
| mir-181 | 130 | 136 | 1a | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
| HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
| HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
| HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
| mir-381 | 2994 | 3000 | 1a | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |