概括
基因 54927
象征 chchd3
同义词 MINOS3 | MIC19 | PPP1R22
描述 包含3个
参考 MIM:613748|HGNC:HGNC:21906|ENSEMBL:ENSG00000106554|HPRD:13044|Vega:Otthumg00000155231
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7Q33
Pascal P值 0.068
Sherlock P值 0.027
胎儿β 0.338
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TAF1 0.89 0.91
C6orf61 0.89 0.89
ATM 0.89 0.91
eya3 0.89 0.89
瓦帕尔 0.89 0.90
KDM3B 0.89 0.90
SMC1A 0.89 0.86
PCM1 0.89 0.91
NEK4 0.88 0.91
BTBD7 0.88 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.66 -0.77
ifi27 -0.65 -0.76
MT-CO2 -0.64 -0.75
higd1b -0.63 -0.75
AF347015.21 -0.63 -0.79
AF347015.27 -0.62 -0.72
mt-cyb -0.62 -0.71
AF347015.8 -0.61 -0.73
FXYD1 -0.61 -0.72
AF347015.33 -0.60 -0.69

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLI1和DAX1 DN的Garcia目标 176 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成6 189 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chung水泡细胞毒性 134 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村脂肪形成晚期 104 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手DN 116 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG RXRA与H4K20me1标记结合 145 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因