基因页:chchd3
概括?
基因 | 54927 |
象征 | chchd3 |
同义词 | MINOS3 | MIC19 | PPP1R22 |
描述 | 包含3个 |
参考 | MIM:613748|HGNC:HGNC:21906|ENSEMBL:ENSG00000106554|HPRD:13044|Vega:Otthumg00000155231 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7Q33 |
Pascal P值 | 0.068 |
Sherlock P值 | 0.027 |
胎儿β | 0.338 |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CHCHD3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TAF1 | 0.89 | 0.91 |
C6orf61 | 0.89 | 0.89 |
ATM | 0.89 | 0.91 |
eya3 | 0.89 | 0.89 |
瓦帕尔 | 0.89 | 0.90 |
KDM3B | 0.89 | 0.90 |
SMC1A | 0.89 | 0.86 |
PCM1 | 0.89 | 0.91 |
NEK4 | 0.88 | 0.91 |
BTBD7 | 0.88 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.66 | -0.77 |
ifi27 | -0.65 | -0.76 |
MT-CO2 | -0.64 | -0.75 |
higd1b | -0.63 | -0.75 |
AF347015.21 | -0.63 | -0.79 |
AF347015.27 | -0.62 | -0.72 |
mt-cyb | -0.62 | -0.71 |
AF347015.8 | -0.61 | -0.73 |
FXYD1 | -0.61 | -0.72 |
AF347015.33 | -0.60 | -0.69 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FLI1和DAX1 DN的Garcia目标 | 176 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成6 | 189 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chung水泡细胞毒性 | 134 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村脂肪形成晚期 | 104 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
li诱导了自然杀手DN | 116 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG RXRA与H4K20me1标记结合 | 145 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |