概括
基因 5493
象征 ppl
同义词 -
描述 Periplakin
参考 MIM:602871|HGNC:HGNC:9273|Ensembl:ENSG00000118898|HPRD:04187|Vega:Otthumg00000129528
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16p13.3
Pascal P值 0.044
Sherlock P值 0.488
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2005820 CHR16 5941963 ppl 5493 0.07 顺式
RS1012259 CHR16 5952908 ppl 5493 0.17 顺式
RS1076573 CHR16 3230887 ppl 5493 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Bag2 0.70 0.68
Gabra2 0.70 0.74
SLC30A1 0.70 0.68
OSGIN2 0.70 0.70
CTSO 0.69 0.72
setd3 0.69 0.69
OSBPL1A 0.69 0.73
DLG1 0.69 0.71
燕麦 0.69 0.69
gpm6b 0.68 0.71
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Bcl7c -0.47 -0.48
SLC16A13 -0.43 -0.43
NME4 -0.41 -0.44
AL645608.4 -0.41 -0.29
透明2 -0.40 -0.42
mutyh -0.40 -0.40
Adamts7 -0.40 -0.35
SH3BP2 -0.40 -0.35
FAM167B -0.40 -0.38
ZNF296 -0.39 -0.33

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
早期的粉刺开发 21 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM对TSA和Decitabine的反应 129 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
威尔科克斯对孕酮的反应 152 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOOI ST7靶向DN 123 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chathafe乳腺癌基础与间充质 121 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rodrigues NTN1靶向DN 158 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Morosetti facioscapulohumeral肌肉分散dn 12 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冷吉非替尼抵抗DN 230 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Barretts食道和食道癌DN 37 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tang衰老TP53靶向DN 57 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AIGNER ZEB1目标 35 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过HIF1A DN的缺氧总缺氧 110 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向 292 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU细胞迁移 184 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过CTNNB1发出的CDH1信号传导 83 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Myc TGFA UP 61 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Myc E2F1 UP 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer E2F1 UP 62 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB目标 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ABE VEGFA目标2小时 34 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DASU IL6信号疤痕向上 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tseng irs1靶向DN 135 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tseng脂肪势DN 46 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JI对FSH的响应 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra靶向DN 105 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞DN 145 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞向上 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜DN 31 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer肿瘤发生DN 51 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hinata NFKB靶向角质形成细胞DN 23 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kobayashi EGFR信号24小时 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 DN目标 82 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ISSAEVA MLL2目标 62 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STAT3 DN的Azare肿瘤转化 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO上皮分化模块 69 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞DN 428 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因