基因页:ppl
概括?
基因 | 5493 |
象征 | ppl |
同义词 | - |
描述 | Periplakin |
参考 | MIM:602871|HGNC:HGNC:9273|Ensembl:ENSG00000118898|HPRD:04187|Vega:Otthumg00000129528 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16p13.3 |
Pascal P值 | 0.044 |
Sherlock P值 | 0.488 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2005820 | CHR16 | 5941963 | ppl | 5493 | 0.07 | 顺式 | ||
RS1012259 | CHR16 | 5952908 | ppl | 5493 | 0.17 | 顺式 | ||
RS1076573 | CHR16 | 3230887 | ppl | 5493 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PPL_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Bag2 | 0.70 | 0.68 |
Gabra2 | 0.70 | 0.74 |
SLC30A1 | 0.70 | 0.68 |
OSGIN2 | 0.70 | 0.70 |
CTSO | 0.69 | 0.72 |
setd3 | 0.69 | 0.69 |
OSBPL1A | 0.69 | 0.73 |
DLG1 | 0.69 | 0.71 |
燕麦 | 0.69 | 0.69 |
gpm6b | 0.68 | 0.71 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Bcl7c | -0.47 | -0.48 |
SLC16A13 | -0.43 | -0.43 |
NME4 | -0.41 | -0.44 |
AL645608.4 | -0.41 | -0.29 |
透明2 | -0.40 | -0.42 |
mutyh | -0.40 | -0.40 |
Adamts7 | -0.40 | -0.35 |
SH3BP2 | -0.40 | -0.35 |
FAM167B | -0.40 | -0.38 |
ZNF296 | -0.39 | -0.33 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
早期的粉刺开发 | 21 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM对TSA和Decitabine的反应 | 129 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 | 391 | 222 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
威尔科克斯对孕酮的反应 | 152 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOOI ST7靶向DN | 123 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chathafe乳腺癌基础与间充质 | 121 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rodrigues NTN1靶向DN | 158 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jaeger转移DN | 258 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名1 DN | 242 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 DN | 281 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Morosetti facioscapulohumeral肌肉分散dn | 12 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
冷吉非替尼抵抗DN | 230 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Barretts食道和食道癌DN | 37 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tang衰老TP53靶向DN | 57 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP63目标 | 355 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AIGNER ZEB1目标 | 35 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过HIF1A DN的缺氧总缺氧 | 110 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向 | 292 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WU细胞迁移 | 184 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过CTNNB1发出的CDH1信号传导 | 83 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Myc TGFA UP | 61 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Myc E2F1 UP | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer E2F1 UP | 62 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 | 182 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ABE VEGFA目标2小时 | 34 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DASU IL6信号疤痕向上 | 30 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tseng irs1靶向DN | 135 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tseng脂肪势DN | 46 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JI对FSH的响应 | 74 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra靶向DN | 105 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞DN | 145 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜DN | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cromer肿瘤发生DN | 51 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hinata NFKB靶向角质形成细胞DN | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kobayashi EGFR信号24小时 | 101 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 DN目标 | 82 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ISSAEVA MLL2目标 | 62 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
STAT3 DN的Azare肿瘤转化 | 17 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rarg Bound MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOSCO上皮分化模块 | 69 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |