基因页面:C1orf109
总结吗?
| GeneID | 54955年 |
| 象征 | C1orf109 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 染色体1 109年开放阅读框 |
| 参考 | MIM: 614799|HGNC: HGNC: 26039|运用:ENSG00000116922|HPRD: 07918|织女:OTTHUMG00000004323 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 1 p34.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.194 |
| 夏洛克假定值 | 0.547 |
| 胎儿β | -0.06 |
| DMG | 2(#研究) |
| eGene | 皮质 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg16580496 | 1 | 38156394 | C1orf109 | 5.024的军医 | -0.357 | 0.047 | DMG: Wockner_2014 |
| cg07997689 | 1 | 38156178 | C1orf109 | 2.79 e-9 | -0.013 | 1.98 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs10799319 | chr1 | 225703484 | C1orf109 | 54955年 | 0.11 | 反式 | ||
| rs7555139 | chr1 | 225716240 | C1orf109 | 54955年 | 0.19 | 反式 | ||
| rs2840958 | chr1 | 225805042 | C1orf109 | 54955年 | 0.17 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 周炎症反应生活的DN | 384年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 奥斯瓦尔德在胶原凝胶DN造血干细胞 | 275年 | 168年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 | 1278年 | 748年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日WT1 DN的目标 | 459年 | 276年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 魏MYCN目标与E箱 | 795年 | 478年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 时候喜欢炎症反应有限合伙人 | 183年 | 115年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 瑞士POSTRADIATION肿瘤逃逸 | 393年 | 244年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森受E2F4如果 | 728年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 开罗肝母细胞癌类了 | 605年 | 377年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标2 DN | 336年 | 211年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |