概括
基因 5496
象征 ppm1g
同义词 pp2cg | pp2cgamma | ppp2cg
描述 蛋白质磷酸酶,Mg2+/Mn2+依赖性1G
参考 MIM:605119|HGNC:HGNC:9278|ENSEMBL:ENSG00000115241|HPRD:09237|Vega:Otthumg0000000097788
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2p23.3
Pascal P值 8.836E-4
Sherlock P值 0.037
胎儿β 0.753
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG17509807 2 27579505 ppm1g 0.001 4.189 DMG:Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
L3MBTL2 0.93 0.89
COPG 0.90 0.88
加尔斯 0.90 0.86
DHDD 0.90 0.88
immt 0.90 0.85
DNAJC11 0.90 0.86
GDI1 0.89 0.86
EIF2AK1 0.89 0.85
maea 0.89 0.87
SFXN1 0.89 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.82 -0.78
AF347015.21 -0.82 -0.79
MT-CO2 -0.81 -0.76
AF347015.8 -0.79 -0.76
AF347015.2 -0.79 -0.74
AF347015.33 -0.77 -0.73
mt-cyb -0.77 -0.73
AF347015.27 -0.77 -0.76
higd1b -0.76 -0.72
AF347015.15 -0.75 -0.72

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西葫芦转移DN 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MA髓样分化DN 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MA髓样差异化 39 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU对维甲酸和NSC682994 DN的响应 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染18小时 178 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成4 48 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin没有MGMT 48小时DN的响应 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 161 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时 148 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戴尔基癌俯卧反应BPA 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇7的时间反应7 76 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HIF1A和FOXA2的Qi缺氧靶标 37 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
双龙雷帕霉素通过TSC1和TSC2敏感 73 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因