基因页:ppm1g
概括?
基因 | 5496 |
象征 | ppm1g |
同义词 | pp2cg | pp2cgamma | ppp2cg |
描述 | 蛋白质磷酸酶,Mg2+/Mn2+依赖性1G |
参考 | MIM:605119|HGNC:HGNC:9278|ENSEMBL:ENSG00000115241|HPRD:09237|Vega:Otthumg0000000097788 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2p23.3 |
Pascal P值 | 8.836E-4 |
Sherlock P值 | 0.037 |
胎儿β | 0.753 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG17509807 | 2 | 27579505 | ppm1g | 0.001 | 4.189 | DMG:Vaneijk_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
L3MBTL2 | 0.93 | 0.89 |
COPG | 0.90 | 0.88 |
加尔斯 | 0.90 | 0.86 |
DHDD | 0.90 | 0.88 |
immt | 0.90 | 0.85 |
DNAJC11 | 0.90 | 0.86 |
GDI1 | 0.89 | 0.86 |
EIF2AK1 | 0.89 | 0.85 |
maea | 0.89 | 0.87 |
SFXN1 | 0.89 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.82 | -0.78 |
AF347015.21 | -0.82 | -0.79 |
MT-CO2 | -0.81 | -0.76 |
AF347015.8 | -0.79 | -0.76 |
AF347015.2 | -0.79 | -0.74 |
AF347015.33 | -0.77 | -0.73 |
mt-cyb | -0.77 | -0.73 |
AF347015.27 | -0.77 | -0.76 |
higd1b | -0.76 | -0.72 |
AF347015.15 | -0.75 | -0.72 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西葫芦转移DN | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MA髓样分化DN | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MA髓样差异化 | 39 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU对维甲酸和NSC682994 DN的响应 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染18小时 | 178 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成4 | 48 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bandres对Carmustin没有MGMT 48小时DN的响应 | 32 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 | 161 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染24小时 | 148 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
戴尔基癌俯卧反应BPA | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇7的时间反应7 | 76 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HIF1A和FOXA2的Qi缺氧靶标 | 37 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
双龙雷帕霉素通过TSC1和TSC2敏感 | 73 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |