基因页面:PINX1
总结吗?
GeneID | 54984年 |
象征 | PINX1 |
同义词 | LPTL |下 |
描述 | PIN2 / TERF1互动,端粒酶抑制剂1 |
参考 | MIM: 606505|HGNC: HGNC: 30046|运用:ENSG00000254093|HPRD: 05934|织女:OTTHUMG00000163808 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 8 p23 |
帕斯卡假定值 | 0.002 |
夏洛克假定值 | 0.345 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.0274 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PINX1_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C3orf17 | 0.75 | 0.74 |
MRPS22 | 0.73 | 0.71 |
ACP1 | 0.72 | 0.70 |
CRBN | 0.72 | 0.69 |
EBAG9 | 0.72 | 0.69 |
C5orf44 | 0.72 | 0.71 |
PAIP2 | 0.72 | 0.74 |
蓝色石灰岩 | 0.71 | 0.72 |
ERGIC2 | 0.71 | 0.73 |
COPS4 | 0.71 | 0.70 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.18 | -0.52 | -0.41 |
AF347015.2 | -0.49 | -0.36 |
AF347015.26 | -0.49 | -0.38 |
MT-CYB | -0.47 | -0.39 |
AF347015.8 | -0.47 | -0.38 |
MT-CO2 | -0.46 | -0.37 |
AF347015.15 | -0.46 | -0.39 |
AF347015.21 | -0.45 | -0.31 |
MT-ATP8 | -0.43 | -0.34 |
AF347015.31 | -0.42 | -0.36 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003674 | molecular_function | ND | - - - - - - | |
去:0003676 | 核酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 17353931 | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0008285 | 负调节细胞增殖 | NAS | 11003615 | |
去:0007004 | 端粒维持通过端粒酶 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0045786 | 负调控细胞周期 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0000781 | 染色体端粒的地区 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005575 | cellular_component | ND | - - - - - - | |
去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005694 | 染色体 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005730 | 核仁 | 国际能源机构 | - - - - - - |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
AHCY | SAHH | S-adenosylhomocysteine水解酶 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
CALM3 | PHKD | PHKD3 | 钙调蛋白3(磷酸化酶激酶,δ) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
CAPRIN1 | GPIAP1 | GPIP137 | M11S1 | caprin-1 | p137GPI | 细胞周期相关蛋白1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
GTPBP4 | CRFG | FLJ10686 | FLJ10690 | FLJ39774 | NGB | NOG1 | 三磷酸鸟苷结合蛋白4 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
HRNR | S100A16 | S100a18 | hornerin | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
MCRS1 | ICP22BP | INO80Q | MCRS2 | MSP58 |只有 | microspherule蛋白1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 15044100 |
PABPC1 | PAB1 |与| PABP1 | PABPC2 | PABPL1 | 保利(A)结合蛋白胞质1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
PABPC4 | 应用程序1 | APP1 | FLJ43938 | PABP4 | iPABP | 保利(A)结合蛋白、胞质4(诱导形式) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
PAFAH1B2 | - - - - - - | Ib acetylhydrolase platelet-activating因素,对碘氧基苯甲醚,β亚基30 kda | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
PLEKHJ1 | FLJ10297 | GNRPX | pleckstrin同源域包含家庭J成员1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
RPL23A | FLJ27455 | MDA20 | 核糖体蛋白L23a | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
RPL31 | MGC88191 | 核糖体蛋白L31 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
RPS10 | MGC88819 | 核糖体蛋白S10 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
RPS16 | - - - - - - | 核糖体蛋白S16 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
RPS19 | DBA | 核糖体蛋白S19 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
RPS28 | - - - - - - | 核糖体蛋白S28 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
RPS3A | FTE1 | MFTL | MGC23240 | 核糖体蛋白S3A | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
TERF1 | 基金会FLJ41416 | PIN2 | TRBF1 | | TRF1 | hTRF1-AS | t-TRF1 | 端粒重复绑定因子(NIMA-interacting) 1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11701125 |
叔 | EST2 | TCS1 | TP2 |泰爱泰党| hEST2 | 端粒酶逆转录酶 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11701125 |
时候 | DKFZp686B1993 | MGC61975 | TRX | TRX1 | 硫氧还蛋白 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
PID端粒酶通路 | 68年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 | 1278年 | 748年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
费雷拉尤因肉瘤不稳定和稳定 | 167年 | 92年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
谢泼德粉碎和燃烧突变 | 197年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
松田自然杀伤细胞分化 | 475年 | 313年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
赫斯HOXA9和MEIS1的目标 | 65年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃早期造血祖 | 532年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MARZEC IL2信号了 | 115年 | 80年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应早期晚了 | 317年 | 190年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李BMP2 DN的目标 | 882年 | 538年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |