基因页：PPP1CB
Summary？
| 基因 | 5500 |
| 象征 | PPP1CB |
| Synonyms | HEL-S-80P | PP-1B | PP1B | PP1BETA | PPP1CD |
| Description | protein phosphatase 1 catalytic subunit beta |
| Reference | MIM：600590|HGNC：HGNC：9282|ENSEMBL：ENSG00000213639|HPRD：11792|Vega:OTTHUMG00000152011 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2P23 |
| Pascal P值 | 0.003 |
| Sherlock p-value | 0.002 |
| 胎儿β | 0.784 |
| 主持人 | Myers' cis & trans 元 |
| 支持 | 细胞内信号转导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP CompositeSet 染色质重塑基因 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | Description | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS3757318 | CHR6 | 151914112 | PPP1CB | 5500 | 0.13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| trub1 | 0.91 | 0.92 |
| NDFIP1 | 0.90 | 0.90 |
| 平静1 | 0.90 | 0.91 |
| YWHAB | 0.90 | 0.90 |
| Rab6a | 0.90 | 0.90 |
| ITFG1 | 0.90 | 0.90 |
| mtpn | 0.89 | 0.89 |
| Elovl4 | 0.88 | 0.89 |
| dlat | 0.87 | 0.87 |
| NECAP1 | 0.87 | 0.86 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.26 | -0.58 | -0.47 |
| EIF4EBP3 | -0.58 | -0.61 |
| GSDMD | -0.58 | -0.57 |
| AP002478.3 | -0.58 | -0.58 |
| AF347015.2 | -0.57 | -0.46 |
| ACSF2 | -0.57 | -0.56 |
| HIGD1B | -0.56 | -0.48 |
| Rab34 | -0.56 | -0.63 |
| FXYD1 | -0.56 | -0.49 |
| MT-CO2 | -0.56 | -0.47 |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| AKAP11 | AKAP220 |DKFZP781I12161 |FLJ11304 |KIAA0629 |PRKA11 | 激酶（PRKA）锚蛋白11 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12147701 |
| ikbkg | AMCBX1 | FIP-3 | FIP3 | Fip3p | IKK-gamma | IP | IP1 | IP2 | IPD2 | NEMO | B细胞，激酶γ中Kappa光多肽基因增强子的抑制剂 | - | HPRD | 14743216 |
| NCL | C23 | FLJ45706 | 核苷 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12185196 |
| PPP1R11 | HCG-V | HCGV | MGC125741 | MGC125742 | MGC125743 | TCTE5 | TCTEX5 | 蛋白质磷酸酶1，调节（抑制剂）亚基11 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| PPP1R12A | MBS |MGC133042 |mypt1 | 蛋白质磷酸酶1，调节（抑制剂）亚基12A | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| PPP1R12B | MGC131980 |MGC87886 |mypt2 | 蛋白质磷酸酶1，调节（抑制剂）亚基12B | - | HPRD,BioGRID | 9570949 |
| PPP1R12C | DKFZP434D0412 |leng3 |p84 | 蛋白质磷酸酶1，调节（抑制剂）亚基12C | - | HPRD | 11399775 |
| PPP1R15A | GADD34 | 蛋白质磷酸酶1，调节（抑制剂）亚基15A | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 表型抑制 |
Biogrid | 11564868|12016208 |
| PPP1R2 | ipp2 |MGC87148 | 蛋白质磷酸酶1，调节（抑制剂）亚基2 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| PPP1R7 | SDS22 | 蛋白质磷酸酶1，调节（抑制剂）亚基7 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| PPP1R8 | ard-1 |ard1 |nipp-1 |nipp1 |Pro2047 | 蛋白质磷酸酶1，调节（抑制剂）亚基8 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| PPP1R9B | FLJ30345 |PPP1R6 |PPP1R9 |Spino |SPN | protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 9B | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 10194355 |
| PTK2 | Fadk |fak |fak1 |pp125fak | PTK2protein tyrosine kinase 2 | - | HPRD,BioGRID | 11513739 |
| RYR2 | arvc2 |arvd2 |VTSIP | ryanodine受体2（心脏） | 共同分级 | Biogrid | 10830164 |
| SH2D4A | FLJ20967 |SH2A | 含4A的SH2域 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| Smarcb1 | BAF47 | INI1 | RDT | SNF5 | SNF5L1 | Sfh1p | Snr1 | hSNFS | SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily b, member 1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 表型增强 重构的复合物 |
Biogrid | 12016208 |
| TMEM33 | 1600019d15rik |FLJ10525 |shinc3 | 跨膜蛋白33 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| WBP11 | DKFZp779M1063 | NPWBP | SIPP1 | WW domain binding protein 11 | - | HPRD | 14640981 |