基因页面:LAMTOR1
总结吗?
GeneID | 55004年 |
象征 | LAMTOR1 |
同义词 | C11orf59 | PDRO | Ragulator1 | p18 | p27RF-Rho |
描述 | 晚endosomal /溶酶体适配器、MAPK和MTOR激活1 |
参考 | MIM: 613510|HGNC: HGNC: 26068|运用:ENSG00000149357|HPRD: 07933|织女:OTTHUMG00000167869 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 11 q13.4 |
帕斯卡假定值 | 0.04 |
夏洛克假定值 | 0.129 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs9364293 | chr6 | 169199078 | LAMTOR1 | 55004年 | 0.08 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/LAMTOR1_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
EDF1 | 0.85 | 0.87 |
INO80E | 0.84 | 0.88 |
MRPS26 | 0.84 | 0.86 |
DRAP1 | 0.84 | 0.86 |
INO80B | 0.83 | 0.84 |
CCDC12 | 0.83 | 0.87 |
C19orf43 | 0.82 | 0.88 |
WDR74 | 0.82 | 0.83 |
PFDN2 | 0.81 | 0.82 |
C11orf48 | 0.81 | 0.80 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.33 | -0.62 | -0.71 |
MT-CO2 | -0.62 | -0.69 |
AF347015.31 | -0.62 | -0.71 |
MT-CYB | -0.61 | -0.72 |
AF347015.2 | -0.60 | -0.71 |
AF347015.9 | -0.60 | -0.74 |
AF347015.8 | -0.59 | -0.70 |
AF347015.15 | -0.59 | -0.72 |
AF347015.26 | -0.58 | -0.70 |
AF347015.27 | -0.58 | -0.69 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN | 800年 | 473年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
洛克伍德在肺癌放大 | 214年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
鲜明的前额叶皮层22 q11删除DN | 517年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
道格拉斯BMI1目标了 | 566年 | 371年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
么时间响应黄体酮集群17 | 181年 | 101年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG 8 d | 658年 | 397年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RATTENBACHER受CELF1 | 467年 | 251年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |