概括
基因 55006
象征 TRMT61B
同义词 -
描述 tRNA甲基转移酶61b
参考 HGNC:HGNC:26070|ENSEMBL:ENSG00000171103|HPRD:07935|Vega:Otthumg00000128433
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2p23.2
Pascal P值 0.006
Sherlock P值 0.316
主持人 尾状基底神经节
皮质
额叶皮质BA9
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10198789 2 28968811 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.211E-6 0.01 124356 gtex_brain_putamen_basal
RS10174533 2 28968928 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.183E-6 0.01 124239 gtex_brain_putamen_basal
RS12714241 2 28969413 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.167E-6 0.01 123754 gtex_brain_putamen_basal
RS966250 2 28974139 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.122E-6 0.01 119028 gtex_brain_putamen_basal
RS4233728 2 28977274 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.418E-6 0.01 115893 gtex_brain_putamen_basal
RS6547873 2 28981983 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.813E-7 0.01 111184 gtex_brain_putamen_basal
RS6547874 2 28982030 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.815E-7 0.01 111137 gtex_brain_putamen_basal
RS12714242 2 28982629 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.599E-7 0.01 110538 gtex_brain_putamen_basal
RS7579321 2 28983166 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.82E-7 0.01 110001 gtex_brain_putamen_basal
RS10865507 2 28983991 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.062e-7 0.01 109176 gtex_brain_putamen_basal
RS397720354 2 28986568 TRMT61B ENSG00000171103.6 3.478E-7 0.01 106599 gtex_brain_putamen_basal
RS6709674 2 28989667 TRMT61B ENSG00000171103.6 5.855e-7 0.01 103500 gtex_brain_putamen_basal
RS6752464 2 28989887 TRMT61B ENSG00000171103.6 3.565e-7 0.01 103280 gtex_brain_putamen_basal
RS12472549 2 28992004 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.346E-6 0.01 101163 gtex_brain_putamen_basal
RS11127189 2 28992020 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.845e-7 0.01 101147 gtex_brain_putamen_basal
RS12714243 2 28992293 TRMT61B ENSG00000171103.6 3.559E-7 0.01 100874 gtex_brain_putamen_basal
RS11686412 2 28992405 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.348e-6 0.01 100762 gtex_brain_putamen_basal
RS6706858 2 28992607 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.349E-6 0.01 100560 gtex_brain_putamen_basal
RS60172496 2 28993652 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.425E-6 0.01 99515 gtex_brain_putamen_basal
RS13007183 2 28993903 TRMT61B ENSG00000171103.6 4.255e-7 0.01 99264 gtex_brain_putamen_basal
RS398071257 2 28994282 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.311E-6 0.01 98885 gtex_brain_putamen_basal
RS10183665 2 28995226 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.601E-7 0.01 97941 gtex_brain_putamen_basal
RS10204329 2 28998077 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.053E-6 0.01 95090 gtex_brain_putamen_basal
RS1128416 2 29001691 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.04E-6 0.01 91476 gtex_brain_putamen_basal
RS201955692 2 29003786 TRMT61B ENSG00000171103.6 9.203E-7 0.01 89381 gtex_brain_putamen_basal
RS72113253 2 29003787 TRMT61B ENSG00000171103.6 3.791E-7 0.01 89380 gtex_brain_putamen_basal
RS12151717 2 29004046 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.601E-7 0.01 89121 gtex_brain_putamen_basal
RS6730321 2 29004299 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.601E-7 0.01 88868 gtex_brain_putamen_basal
RS3768665 2 29005602 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.413E-6 0.01 87565 gtex_brain_putamen_basal
RS3768666 2 29005870 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.601E-7 0.01 87297 gtex_brain_putamen_basal
RS6547877 2 29006591 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.705E-6 0.01 86576 gtex_brain_putamen_basal
RS6742291 2 29007349 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.046E-6 0.01 85818 gtex_brain_putamen_basal
RS145970865 2 29007808 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.05E-6 0.01 85359 gtex_brain_putamen_basal
RS62129843 2 29008175 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.064E-6 0.01 84992 gtex_brain_putamen_basal
RS4632297 2 29008425 TRMT61B ENSG00000171103.6 5.551E-7 0.01 84742 gtex_brain_putamen_basal
RS4254466 2 29009049 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.209E-7 0.01 84118 gtex_brain_putamen_basal
RS4477866 2 29009089 TRMT61B ENSG00000171103.6 4.609E-8 0.01 84078 gtex_brain_putamen_basal
RS6747852 2 29009840 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.046E-6 0.01 83327 gtex_brain_putamen_basal
RS6547878 2 29010066 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.052E-6 0.01 83101 gtex_brain_putamen_basal
RS6419696 2 29010339 TRMT61B ENSG00000171103.6 3.063e-7 0.01 82828 gtex_brain_putamen_basal
RS2045886 2 29010517 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.601E-7 0.01 82650 gtex_brain_putamen_basal
RS34205614 2 29011141 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.601E-7 0.01 82026 gtex_brain_putamen_basal
RS199861660 2 29011335 TRMT61B ENSG00000171103.6 3.286E-7 0.01 81832 gtex_brain_putamen_basal
RS5830089 2 29011337 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.601E-7 0.01 81830 gtex_brain_putamen_basal
RS13016112 2 29012574 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.061E-7 0.01 80593 gtex_brain_putamen_basal
RS13011935 2 29014746 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.601E-7 0.01 78421 gtex_brain_putamen_basal
RS13018031 2 29015982 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.601E-7 0.01 77185 gtex_brain_putamen_basal
RS13019397 2 29016019 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.002E-7 0.01 77148 gtex_brain_putamen_basal
RS146935359 2 29016262 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.601E-7 0.01 76905 gtex_brain_putamen_basal
RS12714246 2 29017358 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.624E-7 0.01 75809 gtex_brain_putamen_basal
RS13030835 2 29017474 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.601E-7 0.01 75693 gtex_brain_putamen_basal
RS6547880 2 29018889 TRMT61B ENSG00000171103.6 3.491E-7 0.01 74278 gtex_brain_putamen_basal
RS57569499 2 29019056 TRMT61B ENSG00000171103.6 3.22E-7 0.01 74111 gtex_brain_putamen_basal
RS35278492 2 29021511 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.914E-7 0.01 71656 gtex_brain_putamen_basal
RS5830090 2 29021814 TRMT61B ENSG00000171103.6 3.059E-7 0.01 71353 gtex_brain_putamen_basal
RS7475 2 29023749 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.601E-7 0.01 69418 gtex_brain_putamen_basal
RS3190 2 29025479 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.697E-7 0.01 67688 gtex_brain_putamen_basal
RS12475612 2 29030006 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.101E-7 0.01 63161 gtex_brain_putamen_basal
RS4132617 2 29031312 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.946E-7 0.01 61855 gtex_brain_putamen_basal
RS7601413 2 29032238 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.601E-7 0.01 60929 gtex_brain_putamen_basal
RS7601720 2 29032478 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.601E-7 0.01 60689 gtex_brain_putamen_basal
RS7601934 2 29032673 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.773E-7 0.01 60494 gtex_brain_putamen_basal
RS6547881 2 29032746 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.601E-7 0.01 60421 gtex_brain_putamen_basal
RS7567861 2 29035849 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.889E-7 0.01 57318 gtex_brain_putamen_basal
RS6547882 2 29037001 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.679E-7 0.01 56166 gtex_brain_putamen_basal
RS13009357 2 29041877 TRMT61B ENSG00000171103.6 3.989E-7 0.01 51290 gtex_brain_putamen_basal
RS11127190 2 29043212 TRMT61B ENSG00000171103.6 7.822e-7 0.01 49955 gtex_brain_putamen_basal
RS62131973 2 29044437 TRMT61B ENSG00000171103.6 5.081E-7 0.01 48730 gtex_brain_putamen_basal
RS13024443 2 29046185 TRMT61B ENSG00000171103.6 6.003E-7 0.01 46982 gtex_brain_putamen_basal
RS62131974 2 29046814 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.687E-6 0.01 46353 gtex_brain_putamen_basal
RS62131975 2 29046908 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.586E-6 0.01 46259 gtex_brain_putamen_basal
RS61407258 2 29046909 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.163E-6 0.01 46258 gtex_brain_putamen_basal
RS6718662 2 29048758 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.688E-6 0.01 44409 gtex_brain_putamen_basal
RS10865508 2 29053704 TRMT61B ENSG00000171103.6 9.095e-7 0.01 39463 gtex_brain_putamen_basal
RS12714249 2 29055916 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.339E-6 0.01 37251 gtex_brain_putamen_basal
RS11685682 2 29056801 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.185E-6 0.01 36366 gtex_brain_putamen_basal
RS67410623 2 29057440 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.226E-6 0.01 35727 gtex_brain_putamen_basal
RS10166861 2 29061111 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.791E-6 0.01 32056 gtex_brain_putamen_basal
RS56789675 2 29062249 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.942E-6 0.01 30918 gtex_brain_putamen_basal
RS4611608 2 29064536 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.792E-6 0.01 28631 gtex_brain_putamen_basal
RS4632298 2 29076282 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.988E-6 0.01 16885 gtex_brain_putamen_basal
RS66904522 2 29080892 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.39E-6 0.01 12275 gtex_brain_putamen_basal
RS57286839 2 29084934 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.13E-6 0.01 8233 gtex_brain_putamen_basal
RS55785599 2 29087814 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.26E-6 0.01 5353 gtex_brain_putamen_basal
RS11684695 2 29088450 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.31E-6 0.01 4717 gtex_brain_putamen_basal
RS4665436 2 29090227 TRMT61B ENSG00000171103.6 2.127E-6 0.01 2940 gtex_brain_putamen_basal
RS4233729 2 29092679 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.288E-6 0.01 488 gtex_brain_putamen_basal
RS4666122 2 29092850 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.288E-6 0.01 317 gtex_brain_putamen_basal
RS4563180 2 29093695 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.431E-6 0.01 -528 gtex_brain_putamen_basal
RS4638745 2 29093803 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.033E-6 0.01 -636 gtex_brain_putamen_basal
RS34611659 2 29094722 TRMT61B ENSG00000171103.6 1.374E-6 0.01 -1555 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
周炎性反应活DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanharanta子宫肌瘤带有7Q删除 67 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LastOwska与MYCN二式增长 43 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
flt3的大风apl突变 56 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因