基因页面:TTC38
总结吗?
| GeneID | 55020年 |
| 象征 | TTC38 |
| 同义词 | LL22NC03-5H6.5 |
| 描述 | tetratricopeptide重复域38 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 26082|运用:ENSG00000075234|HPRD: 07943|织女:OTTHUMG00000150494 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 22个问题 |
| 帕斯卡假定值 | 0.817 |
| 夏洛克假定值 | 0.271 |
| 胎儿β | -0.169 |
| DMG | 2(#研究) |
| eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 皮质 额叶皮质BA9 海马体 硬膜基底神经节 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg03036452 | 22 | 46663545 | TTC38 | 2.446的军医 | -0.539 | 0.037 | DMG: Wockner_2014 |
| cg07387570 | 22 | 46663686 | TTC38 | 2.04 e-8 | -0.013 | 7.05 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs12168702 | 22 | 46659925 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.297 e-6 | 0.02 | -3933年 | gtex_brain_ba24 |
| rs56081982 | 22 | 46660311 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.279 e-6 | 0.02 | -3547年 | gtex_brain_ba24 |
| rs56026857 | 22 | 46660321 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.279 e-6 | 0.02 | -3537年 | gtex_brain_ba24 |
| rs60319170 | 22 | 46660342 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.279 e-6 | 0.02 | -3516年 | gtex_brain_ba24 |
| rs56099920 | 22 | 46660416 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.274 e-6 | 0.02 | -3442年 | gtex_brain_ba24 |
| rs140438140 | 22 | 46660668 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.265 e-6 | 0.02 | -3190年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7290386 | 22 | 46661553 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.231 e-6 | 0.02 | -2305年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7288256 | 22 | 46661859 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.218 e-6 | 0.02 | -1999年 | gtex_brain_ba24 |
| rs60982126 | 22 | 46662092 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.21 e-6 | 0.02 | -1766年 | gtex_brain_ba24 |
| rs111908398 | 22 | 46662151 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.21 e-6 | 0.02 | -1707年 | gtex_brain_ba24 |
| rs60351202 | 22 | 46662239 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.206 e-6 | 0.02 | -1619年 | gtex_brain_ba24 |
| rs9627349 | 22 | 46662527 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.15 e-6 | 0.02 | -1331年 | gtex_brain_ba24 |
| rs9627351 | 22 | 46663094 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.185 e-6 | 0.02 | -764年 | gtex_brain_ba24 |
| rs12168162 | 22 | 46664855 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.185 e-6 | 0.02 | 997年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6008434 | 22 | 46665670 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.426 e - | 0.02 | 1812年 | gtex_brain_ba24 |
| rs9627363 | 22 | 46666161 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.666 e - | 0.02 | 2303年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6008437 | 22 | 46667037 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.426 e - | 0.02 | 3179年 | gtex_brain_ba24 |
| rs13433672 | 22 | 46667653 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.421 e - | 0.02 | 3795年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73177058 | 22 | 46668079 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.666 e - | 0.02 | 4221年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73177060 | 22 | 46668352 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.666 e - | 0.02 | 4494年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6008443 | 22 | 46668692 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.666 e - | 0.02 | 4834年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6008444 | 22 | 46668726 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.666 e - | 0.02 | 4868年 | gtex_brain_ba24 |
| rs58993485 | 22 | 46673400 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.371 e - | 0.02 | 9542年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6007765 | 22 | 46673556 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.213 e - | 0.02 | 9698年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6007766 | 22 | 46673771 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.18 e - | 0.02 | 9913年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73177051 | 22 | 46647388 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 3.426 e - | 0 | -16470年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7293071 | 22 | 46659143 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 6.186 e - | 0 | -4715年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7290021 | 22 | 46659320 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.871 e - | 0 | -4538年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6519995 | 22 | 46659365 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.505 e - | 0 | -4493年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs8137157 | 22 | 46659580 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.163 e - | 0 | -4278年 | gtex_brain_putamen_basal |
| 。 | 22 | 46659697 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.109 e - | 0 | -4161年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12168702 | 22 | 46659925 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.698 e - | 0 | -3933年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs56081982 | 22 | 46660311 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.703 e - | 0 | -3547年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs56026857 | 22 | 46660321 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.703 e - | 0 | -3537年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs60319170 | 22 | 46660342 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.704 e - | 0 | -3516年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs56099920 | 22 | 46660416 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.709 e - | 0 | -3442年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs140438140 | 22 | 46660668 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.73 e - | 0 | -3190年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7290386 | 22 | 46661553 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.896 e - | 0 | -2305年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7288256 | 22 | 46661859 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.991 e - | 0 | -1999年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs60982126 | 22 | 46662092 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.448 e - | 0 | -1766年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs111908398 | 22 | 46662151 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.103 e - | 0 | -1707年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs60351202 | 22 | 46662239 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.142 e - | 0 | -1619年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9627349 | 22 | 46662527 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.282 e - | 0 | -1331年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9627351 | 22 | 46663094 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.421 e - | 0 | -764年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9627352 | 22 | 46663287 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.81 e - | 0 | -571年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9627353 | 22 | 46663322 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.746 e - | 0 | -536年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9627359 | 22 | 46664431 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.847 e-8 | 0 | 573年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9627360 | 22 | 46664638 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.847 e-8 | 0 | 780年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12168162 | 22 | 46664855 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 3.896 e-8 | 0 | 997年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6008434 | 22 | 46665670 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 3.104 e-9 | 0 | 1812年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9627363 | 22 | 46666161 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 6.839 e-9 | 0 | 2303年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6008437 | 22 | 46667037 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.368 e-9 | 0 | 3179年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs13433672 | 22 | 46667653 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.366 e-9 | 0 | 3795年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs73177058 | 22 | 46668079 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 6.839 e-9 | 0 | 4221年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs73177060 | 22 | 46668352 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 6.219 e-9 | 0 | 4494年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6008443 | 22 | 46668692 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 6.839 e-9 | 0 | 4834年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6008444 | 22 | 46668726 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 6.839 e-9 | 0 | 4868年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs200901934 | 22 | 46672668 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 2.729 e - | 0 | 8810年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs199523173 | 22 | 46672927 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.129 e - | 0 | 9069年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs58993485 | 22 | 46673400 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 4.685 e-9 | 0 | 9542年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6007765 | 22 | 46673556 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 4.698 e-9 | 0 | 9698年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6007766 | 22 | 46673771 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 4.537 e-9 | 0 | 9913年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6008468 | 22 | 46674212 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.993 e-8 | 0 | 10354年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6008495 | 22 | 46677904 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 4.982平台以及 | 0 | 14046年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11090858 | 22 | 46677997 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.062平台以及 | 0 | 14139年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6008497 | 22 | 46678666 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 14808年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7284287 | 22 | 46679657 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 15799年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs199614755 | 22 | 46679848 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 3.213 e-9 | 0 | 15990年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs200520977 | 22 | 46679849 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 15991年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6008506 | 22 | 46680021 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 16163年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6007794 | 22 | 46685017 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 21159年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6008534 | 22 | 46685249 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 21391年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs66702225 | 22 | 46686480 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.642 e - | 0 | 22622年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs73886792 | 22 | 46687220 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 23362年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs73886794 | 22 | 46687268 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 23410年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs147696491 | 22 | 46687758 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 23900年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs376498297 | 22 | 46687859 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.461 e-9 | 0 | 24001年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6008552 | 22 | 46688208 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 24350年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6008553 | 22 | 46688321 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 24463年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs57866552 | 22 | 46689229 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 25371年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs58980421 | 22 | 46689347 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 25489年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs192865370 | 22 | 46690554 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 26696年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs55832024 | 22 | 46690714 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 26856年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs58704441 | 22 | 46690861 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 27003年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs8140182 | 22 | 46691400 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 27542年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7290732 | 22 | 46691903 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 28045年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7286885 | 22 | 46692182 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 9.525 e-8 | 0 | 28324年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7285629 | 22 | 46692203 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 28345年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs138494076 | 22 | 46692397 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 6.911 e-9 | 0 | 28539年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs58434356 | 22 | 46692905 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 8.522 e-9 | 0 | 29047年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs60032274 | 22 | 46693060 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 5.144平台以及 | 0 | 29202年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9627425 | 22 | 46763821 | TTC38 | ENSG00000075234.12 | 1.046 e-6 | 0 | 99963年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 父母MTOR信号了 | 567年 | 375年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 林格伦膀胱癌集群3 DN | 229年 | 142年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NUYTTEN NIPP1目标 | 848年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH自行车基因 | 648年 | 385年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 常它由HPV31 | 84年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHEDDEN肺癌生存A6差 | 456年 | 285年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 汉SATB1 DN的目标 | 442年 | 275年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳和H3 UNMETHYLATED人大HCP | 536年 | 296年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOYAULT肝癌子类G3 DN | 51 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WHITFIELD细胞周期G2 | 182年 | 102年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RATTENBACHER受CELF1 | 467年 | 251年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG下降2 EGF的脉搏 | 293年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |