概括
基因 55022
象征 PID1
同义词 HMFN2073 | NYGGF4 | P-CLI1 | PCLI1
描述 包含1个的磷酸酪氨酸相互作用结构
参考 MIM:612930|HGNC:HGNC:26084|ENSEMBL:ENSG00000153823|HPRD:07944|Vega:Otthumg00000133191
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q36.3
Pascal P值 0.012
Sherlock P值 0.208
胎儿β 0.424
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2809658 CHR1 43050395 PID1 55022 0.03 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ptprj 0.90 0.91
phlpp2 0.87 0.87
ENTPD4 0.87 0.88
PNMAL1 0.87 0.87
AP3M2 0.87 0.88
ABR 0.87 0.87
tgoln2 0.86 0.87
SCN3B 0.86 0.85
htt 0.85 0.87
mef2a 0.85 0.88
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.53 -0.47
AL139819.3 -0.50 -0.51
AF347015.18 -0.49 -0.45
higd1b -0.49 -0.45
AP002478.3 -0.48 -0.47
MT-CO2 -0.48 -0.45
AF347015.8 -0.48 -0.44
AC098691.2 -0.47 -0.48
GNG11 -0.47 -0.47
C1orf54 -0.47 -0.51

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
早期的粉刺开发 21 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 205 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 10D DN的Takeda目标 142 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄端癌DN 82 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发12小时 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发和癌症Box5 11 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2向上 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈里斯脑癌祖细胞 44 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞向上 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村转移模型DN 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF DN的响应 235 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 229 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STAT3的Azare肿瘤转化 121 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因