基因页:PID1
概括?
基因 | 55022 |
象征 | PID1 |
同义词 | HMFN2073 | NYGGF4 | P-CLI1 | PCLI1 |
描述 | 包含1个的磷酸酪氨酸相互作用结构 |
参考 | MIM:612930|HGNC:HGNC:26084|ENSEMBL:ENSG00000153823|HPRD:07944|Vega:Otthumg00000133191 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q36.3 |
Pascal P值 | 0.012 |
Sherlock P值 | 0.208 |
胎儿β | 0.424 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2809658 | CHR1 | 43050395 | PID1 | 55022 | 0.03 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PID1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ptprj | 0.90 | 0.91 |
phlpp2 | 0.87 | 0.87 |
ENTPD4 | 0.87 | 0.88 |
PNMAL1 | 0.87 | 0.87 |
AP3M2 | 0.87 | 0.88 |
ABR | 0.87 | 0.87 |
tgoln2 | 0.86 | 0.87 |
SCN3B | 0.86 | 0.85 |
htt | 0.85 | 0.87 |
mef2a | 0.85 | 0.88 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.53 | -0.47 |
AL139819.3 | -0.50 | -0.51 |
AF347015.18 | -0.49 | -0.45 |
higd1b | -0.49 | -0.45 |
AP002478.3 | -0.48 | -0.47 |
MT-CO2 | -0.48 | -0.45 |
AF347015.8 | -0.48 | -0.44 |
AC098691.2 | -0.47 | -0.48 |
GNG11 | -0.47 | -0.47 |
C1orf54 | -0.47 | -0.51 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
早期的粉刺开发 | 21 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 | 205 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 10D DN的Takeda目标 | 142 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 | 329 | 219 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄端癌DN | 82 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发12小时 | 116 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发和癌症Box5 | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2向上 | 256 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈里斯脑癌祖细胞 | 44 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村转移模型DN | 43 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 | 315 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF DN的响应 | 235 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 | 229 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
STAT3的Azare肿瘤转化 | 121 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |