概括
基因 55023
象征 phip
同义词 BRWD2 | DCAF14 | WDR11 | NDRP
描述 pleckstrin同源域相互作用蛋白
参考 MIM:612870|HGNC:HGNC:15673|ENSEMBL:ENSG00000146247|HPRD:10152|Vega:Otthumg0000000015071
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q14
Pascal P值 0.574
Sherlock P值 0.778
胎儿β 1.771
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG25728543 6 79681550 phip 2.524E-4 0.201 0.037 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12923113 CHR16 49614517 phip 55023 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PDXDC1 0.93 0.95
NFX1 0.93 0.95
TP53BP1 0.93 0.95
Stau1 0.93 0.94
C1orf163 0.92 0.94
LSG1 0.92 0.94
CSNK2A1 0.92 0.94
ACTR8 0.92 0.94
FAM161B 0.92 0.93
terf2 0.92 0.94
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.82 -0.89
MT-CO2 -0.80 -0.88
AF347015.27 -0.79 -0.86
FXYD1 -0.78 -0.86
AF347015.8 -0.77 -0.87
AF347015.33 -0.77 -0.84
mt-cyb -0.77 -0.84
ifi27 -0.76 -0.85
higd1b -0.76 -0.85
AF347015.21 -0.75 -0.88

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Tien肠益生菌2小时DN 88 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 170 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI甲状腺癌簇1 51 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙齿龋齿DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G6 153 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra靶向DN 105 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SAGIV CD24目标 23 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bhati G2M被2methoxyestradiol逮捕 125 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36小时DN 185 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与T 9 11易位 130 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期S 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gabriely miR21靶标 289 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1通过NFIC 10HR DN信号传导 30 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因