基因页:银行1
概括?
基因 | 55024 |
象征 | 银行1 |
同义词 | 银行 |
描述 | B细胞支架蛋白质脚踝蛋白重复1 |
参考 | MIM:610292|HGNC:HGNC:18233|Ensembl:ENSG00000153064|HPRD:09819|Vega:Otthumg00000160958 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q24 |
Pascal P值 | 5.245e-4 |
胎儿β | -1.364 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:PGC128
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS35518360 | CHR4 | 103146890 | 在 | 9.562e-13 | 基因间 | Bank1,SLC39A8 | dist = 150921; dist = 25308 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/BANK1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
rabggta | 0.89 | 0.88 |
ACOT7 | 0.88 | 0.85 |
RTN2 | 0.88 | 0.90 |
MAP2K2 | 0.87 | 0.84 |
ST3GAL3 | 0.87 | 0.85 |
EGLN2 | 0.86 | 0.87 |
FAM69B | 0.86 | 0.88 |
MPND | 0.85 | 0.88 |
ankrd13d | 0.85 | 0.86 |
C7orf43 | 0.85 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.69 | -0.70 |
AF347015.8 | -0.69 | -0.68 |
AF347015.31 | -0.67 | -0.65 |
AF347015.33 | -0.67 | -0.66 |
AF347015.2 | -0.67 | -0.65 |
mt-cyb | -0.67 | -0.67 |
MT-CO2 | -0.67 | -0.64 |
AF347015.15 | -0.66 | -0.65 |
AF347015.26 | -0.65 | -0.66 |
MT-ATP8 | -0.64 | -0.72 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huttmann B Cll生存不良DN | 60 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 | 165 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 UP | 89 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HADDAD B淋巴细胞祖细胞 | 293 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1定位DN的Alcalay AML | 184 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1突变DN的Verhaak AML | 246 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
池子侵入性乳腺癌 | 288 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga Stat5a靶向DN | 213 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 | 308 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |