基因页:TMEM51
概括?
基因 | 55092 |
象征 | TMEM51 |
同义词 | C1orf72 |
描述 | 跨膜蛋白51 |
参考 | HGNC:HGNC:25488|ENSEMBL:ENSG00000171729|HPRD:07651|Vega:Otthumg00000002046 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p36.21 |
Pascal P值 | 0.49 |
Sherlock P值 | 0.51 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | TMEM51 | 55092 | 6.036E-8 | 反式 | ||
RS3845734 | CHR2 | 171125572 | TMEM51 | 55092 | 9.242e-5 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | TMEM51 | 55092 | 9.718e-10 | 反式 | ||
RS16889812 | CHR4 | 14195043 | TMEM51 | 55092 | 0.11 | 反式 | ||
RS16889813 | CHR4 | 14196540 | TMEM51 | 55092 | 0.01 | 反式 | ||
RS2183142 | CHR4 | 159232695 | TMEM51 | 55092 | 0.04 | 反式 | ||
RS17762315 | CHR5 | 76807576 | TMEM51 | 55092 | 0 | 反式 | ||
RS9461864 | CHR6 | 33481468 | TMEM51 | 55092 | 0.01 | 反式 | ||
RS2530313 | CHR7 | 148112233 | TMEM51 | 55092 | 0.07 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | TMEM51 | 55092 | 1.482E-16 | 反式 | ||
RS16996066 | CHR20 | 50135843 | TMEM51 | 55092 | 0.2 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TMEM51_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房3 4WK | 214 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江缺氧癌 | 83 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过p38完成的phong TNF响应 | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |