基因页面:SAMD4B
总结吗?
GeneID | 55095年 |
象征 | SAMD4B |
同义词 | SMGB | Smaug2 |
描述 | 无菌α主题域包含4 b |
参考 | HGNC: HGNC: 25492|运用:ENSG00000179134|HPRD: 10960|织女:OTTHUMG00000182967 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 19 q13.2 |
帕斯卡假定值 | 0.15 |
夏洛克假定值 | 0.022 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
支持 | CompositeSet 达内尔FMRP目标 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs17839618 | chr5 | 128477438 | SAMD4B | 55095年 | 0.12 | 反式 | ||
rs8089917 | chr18 | 73363948 | SAMD4B | 55095年 | 0.03 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SAMD4B_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C17orf70 | 0.86 | 0.88 |
TRIM46 | 0.86 | 0.87 |
ISYNA1 | 0.85 | 0.85 |
PODXL2 | 0.85 | 0.88 |
FAM171A2 | 0.85 | 0.88 |
DCAF15 | 0.85 | 0.90 |
JUP | 0.85 | 0.86 |
GTF2H4 | 0.84 | 0.85 |
GPR172A | 0.84 | 0.89 |
LRWD1 | 0.84 | 0.89 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.70 | -0.83 |
AF347015.31 | -0.69 | -0.81 |
MT-CO2 | -0.68 | -0.81 |
AF347015.33 | -0.68 | -0.81 |
AF347015.8 | -0.67 | -0.81 |
C5orf53 | -0.66 | -0.70 |
MT-CYB | -0.66 | -0.80 |
S100B | -0.64 | -0.74 |
AF347015.15 | -0.63 | -0.78 |
HLA-F | -0.63 | -0.67 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
奥斯曼膀胱癌DN | 406年 | 230年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
在胰腺癌HEIDENBLAD放大 | 31日 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时 | 953年 | 554年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE TOSEDOSTAT反应24小时 | 783年 | 442年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马森受FOXP3刺激 | 1022年 | 619年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KUUSELO胰腺癌19问题放大 | 35 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王肿瘤侵袭性了 | 374年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN YOSHIMURA MAPK8目标 | 366年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |