概括
基因 55106
象征 SLFN12
同义词 SLFN3
描述 Schlafen家庭成员12
参考 MIM:614955|HGNC:HGNC:25500|ENSEMBL:ENSG00000172123|HPRD:08543|Vega:Otthumg00000132952
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q12
Pascal P值 0.687
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG03237218 17 33760527 SLFN12 4.39E-4 -0.335 0.045 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
fto 0.92 0.93
Rabgef1 0.92 0.92
AP1G1 0.91 0.92
ZFYVE1 0.91 0.92
PDE12 0.91 0.92
Golph3 0.91 0.92
RNF111 0.91 0.92
pafah1b2 0.91 0.92
ASB8 0.91 0.91
polr3a 0.91 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.80 -0.85
MT-CO2 -0.80 -0.85
AF347015.8 -0.78 -0.84
mt-cyb -0.77 -0.82
AF347015.33 -0.77 -0.81
AF347015.27 -0.77 -0.82
AF347015.21 -0.76 -0.85
FXYD1 -0.75 -0.82
AF347015.15 -0.74 -0.81
AF347015.2 -0.74 -0.79

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Casorelli apl Secondary vs de从头上升 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 211 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 94 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ropero HDAC2目标 114 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bystroem与IL5 DN相关 64 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕色髓样细胞的发育 165 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Galindo对肠毒素的免疫反应 85 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nemeth炎症反应LPS 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang由Hoxa9和Meis1 Up永生 31 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克道尔急性肺损伤 45 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 212 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng IL22发出信号 56 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黑川肝癌早期复发DN 7 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMAD1和SMAD5 DN抑制Pangas肿瘤 157 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma ns 162 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因