基因页:SLFN12
概括?
基因 | 55106 |
象征 | SLFN12 |
同义词 | SLFN3 |
描述 | Schlafen家庭成员12 |
参考 | MIM:614955|HGNC:HGNC:25500|ENSEMBL:ENSG00000172123|HPRD:08543|Vega:Otthumg00000132952 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q12 |
Pascal P值 | 0.687 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG03237218 | 17 | 33760527 | SLFN12 | 4.39E-4 | -0.335 | 0.045 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
fto | 0.92 | 0.93 |
Rabgef1 | 0.92 | 0.92 |
AP1G1 | 0.91 | 0.92 |
ZFYVE1 | 0.91 | 0.92 |
PDE12 | 0.91 | 0.92 |
Golph3 | 0.91 | 0.92 |
RNF111 | 0.91 | 0.92 |
pafah1b2 | 0.91 | 0.92 |
ASB8 | 0.91 | 0.91 |
polr3a | 0.91 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.80 | -0.85 |
MT-CO2 | -0.80 | -0.85 |
AF347015.8 | -0.78 | -0.84 |
mt-cyb | -0.77 | -0.82 |
AF347015.33 | -0.77 | -0.81 |
AF347015.27 | -0.77 | -0.82 |
AF347015.21 | -0.76 | -0.85 |
FXYD1 | -0.75 | -0.82 |
AF347015.15 | -0.74 | -0.81 |
AF347015.2 | -0.74 | -0.79 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Casorelli apl Secondary vs de从头上升 | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 | 211 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 | 94 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ropero HDAC2目标 | 114 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bystroem与IL5 DN相关 | 64 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕色髓样细胞的发育 | 165 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Galindo对肠毒素的免疫反应 | 85 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nemeth炎症反应LPS | 88 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang由Hoxa9和Meis1 Up永生 | 31 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克道尔急性肺损伤 | 45 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标 | 212 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
华莱士前列腺癌竞赛 | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng IL22发出信号 | 56 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黑川肝癌早期复发DN | 7 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMAD1和SMAD5 DN抑制Pangas肿瘤 | 157 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durand Stroma ns | 162 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |