概括
基因 5511
象征 PPP1R8
同义词 ard-1 | ard1 | nipp-1 | nipp1 | pro2047
描述 蛋白质磷酸酶1调节亚基8
参考 MIM:602636|HGNC:HGNC:9296|ENSEMBL:ENSG00000117751|HPRD:04028|Vega:Otthumg00000003734
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p35.3
Pascal P值 0.307
Sherlock P值 0.369
胎儿β 0.504
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
Ch.1.928723r 1 28176880 PPP1R8 1.532E-4 -0.53 0.032 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
C14orf1 ERG28 |Net51 染色体14开放阅读框1 两个杂交 Biogrid 16169070
C7orf64 DKFZP564O0523 |DKFZP686D1651 |HSPC304 染色体7开放阅读框64 两个杂交 Biogrid 16169070
cdc5l CEF1 |KIAA0432 |PCDC5RP |DJ319D22.1 |HCDC5 CDC5细胞分裂周期5类(S. pombe) - HPRD,Biogrid 10827081
CRMP1 dpysl1 |DRP-1 |DRP1 折叠蛋白反应介质蛋白1 两个杂交 Biogrid 16169070
埃德 注意|等待1 胚胎外胚层开发 - HPRD,Biogrid 12788942
GBP2 - 鸟烯基结合蛋白2,干扰素诱导 两个杂交 Biogrid 16169070
HDAC2 RPD3 |yaf1 组蛋白脱乙酰基酶2 - HPRD,Biogrid 12788942
林恩 FLJ26625 |JTK8 V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒相关的癌基因同源物 - HPRD,Biogrid 11104670
NME2 MGC111212 |NDPK-B |NDPKB |NM23-H2 |NM23B |puf 非转移细胞2,蛋白质(NM23B)在 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
PPP1CA MGC15877 |MGC1674 |PP-1A |PPP1A 蛋白质磷酸酶1,催化亚基,α同工型 重构的复合物 Biogrid 10637318|12788942
PPP1CB MGC3672 |pp-1b |ppp1cd 蛋白质磷酸酶1,催化亚基,β同工型 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
ppp1cc ppp1g 蛋白质磷酸酶1,催化亚基,γ同工型 重构的复合物 Biogrid 11104670
Prkaca MGC102831 |MGC48865 |pkaca 蛋白激酶,cAMP依赖性,催化,α 生化活动 Biogrid 9407077
setDB1 eset |kg1t |KIAA0067 |KMT1E 设定域,分叉1 两个杂交 Biogrid 16169070
SF3B1 prp10 |PRPF10 |SAP155 |SF3B155 剪接因子3B,亚基1,155KDA 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 12105215
STC2 STC-2 |stcrp Stanniocalcin 2 两个杂交 Biogrid 16169070


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN 196 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房5 6WK 116 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson遗传毒性签名 105 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TBH和H2O2的Weigel氧化应激 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线低剂量 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MariaDason对姜黄素Sulindac 7的反应 19 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿隆索转移 198 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hofmann骨髓增生综合征风险DN 23 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因