基因页:PPP1R8
概括?
基因 | 5511 |
象征 | PPP1R8 |
同义词 | ard-1 | ard1 | nipp-1 | nipp1 | pro2047 |
描述 | 蛋白质磷酸酶1调节亚基8 |
参考 | MIM:602636|HGNC:HGNC:9296|ENSEMBL:ENSG00000117751|HPRD:04028|Vega:Otthumg00000003734 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p35.3 |
Pascal P值 | 0.307 |
Sherlock P值 | 0.369 |
胎儿β | 0.504 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Ch.1.928723r | 1 | 28176880 | PPP1R8 | 1.532E-4 | -0.53 | 0.032 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PPP1R8_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
C14orf1 | ERG28 |Net51 | 染色体14开放阅读框1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
C7orf64 | DKFZP564O0523 |DKFZP686D1651 |HSPC304 | 染色体7开放阅读框64 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
cdc5l | CEF1 |KIAA0432 |PCDC5RP |DJ319D22.1 |HCDC5 | CDC5细胞分裂周期5类(S. pombe) | - | HPRD,Biogrid | 10827081 |
CRMP1 | dpysl1 |DRP-1 |DRP1 | 折叠蛋白反应介质蛋白1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
埃德 | 注意|等待1 | 胚胎外胚层开发 | - | HPRD,Biogrid | 12788942 |
GBP2 | - | 鸟烯基结合蛋白2,干扰素诱导 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
HDAC2 | RPD3 |yaf1 | 组蛋白脱乙酰基酶2 | - | HPRD,Biogrid | 12788942 |
林恩 | FLJ26625 |JTK8 | V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒相关的癌基因同源物 | - | HPRD,Biogrid | 11104670 |
NME2 | MGC111212 |NDPK-B |NDPKB |NM23-H2 |NM23B |puf | 非转移细胞2,蛋白质(NM23B)在 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
PPP1CA | MGC15877 |MGC1674 |PP-1A |PPP1A | 蛋白质磷酸酶1,催化亚基,α同工型 | 重构的复合物 | Biogrid | 10637318|12788942 |
PPP1CB | MGC3672 |pp-1b |ppp1cd | 蛋白质磷酸酶1,催化亚基,β同工型 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
ppp1cc | ppp1g | 蛋白质磷酸酶1,催化亚基,γ同工型 | 重构的复合物 | Biogrid | 11104670 |
Prkaca | MGC102831 |MGC48865 |pkaca | 蛋白激酶,cAMP依赖性,催化,α | 生化活动 | Biogrid | 9407077 |
setDB1 | eset |kg1t |KIAA0067 |KMT1E | 设定域,分叉1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
SF3B1 | prp10 |PRPF10 |SAP155 |SF3B155 | 剪接因子3B,亚基1,155KDA | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 12105215 |
STC2 | STC-2 |stcrp | Stanniocalcin 2 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名1向上 | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN | 196 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房5 6WK | 116 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson遗传毒性签名 | 105 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TBH和H2O2的Weigel氧化应激 | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线低剂量 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MariaDason对姜黄素Sulindac 7的反应 | 19 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿隆索转移 | 198 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hofmann骨髓增生综合征风险DN | 23 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |