基因页面:FIGN
总结吗?
GeneID | 55137年 |
象征 | FIGN |
同义词 | - - - - - - |
描述 | fidgetin |
参考 | MIM: 605295|HGNC: HGNC: 13285|HPRD: 07287| |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 2 q24.3 |
帕斯卡假定值 | 0.234 |
胎儿β | -0.373 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.02395 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FIGN_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005524 | ATP结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0017111 | nucleoside-triphosphatase活动 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
王LMO4目标了 | 372年 | 227年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
VECCHI胃癌早期DN | 367年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
武田的目标NUP98 HOXA9融合6小时 | 85年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SENESE HDAC1和HDAC2目标DN | 232年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN SENESE HDAC3目标 | 536年 | 332年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗德里格斯甲状腺未分化癌 | 722年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN GOZGIT ESR1目标 | 781年 | 465年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MCBRYAN发育期乳房4 5周 | 271年 | 175年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MCBRYAN发育期乳房5 6周DN | 137年 | 97年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN MOHANKUMAR TLX1目标 | 193年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
道森在淋巴瘤TCL1甲基化 | 59 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
魏MIR34A目标 | 148年 | 97年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
廖转移 | 539年 | 324年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BOYERINAS瘤胎LET7A1的目标 | 12 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
拉贝风TGFB1 DN的目标 | 108年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FIRESTEIN扩散 | 175年 | 125年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
gabriele MIR21目标 | 289年 | 187年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
约翰斯通PARVB目标2 DN | 336年 | 211年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOBERT少突细胞分化了 | 570年 | 339年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
杨BCL3目标了 | 364年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
德拉克洛瓦RARG绑定MEF | 367年 | 231年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
德拉克洛瓦RAR DN的目标 | 24 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
田BHLHA15目标 | 16 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RATTENBACHER受CELF1 | 467年 | 251年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG下降2 EGF的脉搏 | 293年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
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UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
let-7/98 | 1402年 | 1409年 | 1、m8 | hsa-let-7a大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU |
hsa-let-7b大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU | ||||
hsa-let-7c大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU | ||||
hsa-let-7d大脑 | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU | ||||
hsa-let-7e大脑 | UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU | ||||
hsa-let-7f大脑 | UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU | ||||
hsa - mir - 98大脑 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU | ||||
hsa-let-7g深圳 | UGAGGUAGUAGUUUGUACAGU | ||||
hsa-let-7i大脑 | UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU | ||||
hsa-let-7a大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU | ||||
hsa-let-7b大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU | ||||
hsa-let-7c大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU | ||||
hsa-let-7d大脑 | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU | ||||
hsa-let-7e大脑 | UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU | ||||
hsa-let-7f大脑 | UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU | ||||
hsa - mir - 98大脑 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU | ||||
hsa-let-7g深圳 | UGAGGUAGUAGUUUGUACAGU | ||||
hsa-let-7i大脑 | UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU | ||||
miR-10 | 554年 | 561年 | 1、m8 | hsa-miR-10a | UACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUG |
hsa-miR-10b | UACCCUGUAGAACCGAAUUUGU | ||||
mir - 129 - 5 - p | 615年 | 621年 | m8 | hsa - mir - 129大脑 | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC |
hsa - mir - 129 - 5 - p | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU | ||||
mir - 142 - 5 - p | 715年 | 722年 | 1、m8 | hsa - mir - 142 - 5 - p | CAUAAAGUAGAAAGCACUAC |
mir - 181 | 1787年 | 1794年 | 1、m8 | hsa - mir - 181 a大脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU |
hsa - mir - 181 b深圳 | AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG | ||||
hsa - mir - 181 c大脑 | AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU | ||||
hsa - mir - 181 d大脑 | AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU | ||||
hsa - mir - 181 a大脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU | ||||
hsa - mir - 181 b深圳 | AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG | ||||
hsa - mir - 181 c大脑 | AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU | ||||
hsa - mir - 181 d大脑 | AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU | ||||
mir - 214 | 683年 | 689年 | 1 | hsa - mir - 214大脑 | ACAGCAGGCACAGACAGGCAG |
mir - 320 | 417年 | 423年 | 1 | hsa - mir - 320 | AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA |
miR-34/449 | 1752年 | 1758年 | m8 | hsa-miR-34a大脑 | UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU |
hsa-miR-34c | AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC | ||||
hsa - mir - 449 | UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU | ||||
hsa - mir - 449 b | AGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGC | ||||
mir - 376 c | 676年 | 682年 | 1 | hsa - mir - 376 c | AACAUAGAGGAAAUUCCACG |
mir - 378 | 623年 | 629年 | 1 | hsa - mir - 378 | CUCCUGACUCCAGGUCCUGUGU |
mir - 450 | 615年 | 621年 | 1 | hsa - mir - 450 | UUUUUGCGAUGUGUUCCUAAUA |
mir - 488 | 568年 | 574年 | 1 | hsa - mir - 488 | CCCAGAUAAUGGCACUCUCAA |
mir - 493 - 5 - p | 1893年 | 1899年 | m8 | hsa - mir - 493 - 5 - p | UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU |
mir - 500 | 265年 | 272年 | 1、m8 | hsa - mir - 500 | AUGCACCUGGGCAAGGAUUCUG |
mir - 505 | 305年 | 311年 | m8 | hsa - mir - 505 | GUCAACACUUGCUGGUUUCCUC |
hsa - mir - 505 | GUCAACACUUGCUGGUUUCCUC | ||||
mir - 543 | 29日 | 35 | m8 | hsa - mir - 543 | AAACAUUCGCGGUGCACUUCU |
hsa - mir - 543 | AAACAUUCGCGGUGCACUUCU |