总结吗?
GeneID 55140年
象征 ELP3
同义词 KAT9
描述 延伸机乙酰转移酶复合体亚基3
参考 MIM: 612722|HGNC: HGNC: 20696|运用:ENSG00000134014|HPRD: 10936|织女:OTTHUMG00000102124
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 8 p21.1
帕斯卡假定值 0.019
夏洛克假定值 0.852
胎儿β -0.092
eGene 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
海马体
下丘脑
伏隔核基底神经节
硬膜基底神经节

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症GWASdb记录
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描分析 Psr: 0.031
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) Psr: 0.03086
GSMA_IIE 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) Psr: 0.00057

部分即遗传学和表观遗传学注释

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs13251987 8 27935535 ELP3 ENSG00000134014.12 1.011 e-6 0.01 -11655年 gtex_brain_putamen_basal
rs397715561 8 27938863 ELP3 ENSG00000134014.12 2.805 e-6 0.01 -8327年 gtex_brain_putamen_basal
rs35221601 8 27946015 ELP3 ENSG00000134014.12 1.08 e-6 0.01 -1175年 gtex_brain_putamen_basal
rs1377338 8 27946373 ELP3 ENSG00000134014.12 1.048 e-6 0.01 -817年 gtex_brain_putamen_basal
rs4732816 8 27947607 ELP3 ENSG00000134014.12 1.84 e-6 0.01 417年 gtex_brain_putamen_basal
rs11779927 8 27947787 ELP3 ENSG00000134014.12 8.521 e - 0.01 597年 gtex_brain_putamen_basal
rs201756860 8 27947992 ELP3 ENSG00000134014.12 3.962 e-6 0.01 802年 gtex_brain_putamen_basal
rs34247390 8 27948535 ELP3 ENSG00000134014.12 5.704 e - 0.01 1345年 gtex_brain_putamen_basal
rs28507502 8 27950008 ELP3 ENSG00000134014.12 5.081 e - 0.01 2818年 gtex_brain_putamen_basal
rs2305452 8 27950535 ELP3 ENSG00000134014.12 7.093 e - 0.01 3345年 gtex_brain_putamen_basal
rs2305451 8 27950670 ELP3 ENSG00000134014.12 7.114 e - 0.01 3480年 gtex_brain_putamen_basal
rs11786004 8 27951025 ELP3 ENSG00000134014.12 1.913 e-6 0.01 3835年 gtex_brain_putamen_basal
rs13261052 8 27953876 ELP3 ENSG00000134014.12 1.944 e-6 0.01 6686年 gtex_brain_putamen_basal
rs1563055 8 27954465 ELP3 ENSG00000134014.12 1.907 e-6 0.01 7275年 gtex_brain_putamen_basal
rs2290371 8 27957313 ELP3 ENSG00000134014.12 5.029 e - 0.01 10123年 gtex_brain_putamen_basal
rs4732820 8 27963212 ELP3 ENSG00000134014.12 7.623 e - 0.01 16022年 gtex_brain_putamen_basal
rs4732822 8 27969805 ELP3 ENSG00000134014.12 5.165 e - 0.01 22615年 gtex_brain_putamen_basal
rs34460067 8 27982152 ELP3 ENSG00000134014.12 5.165 e - 0.01 34962年 gtex_brain_putamen_basal
rs12548838 8 27982954 ELP3 ENSG00000134014.12 5.876 e - 0.01 35764年 gtex_brain_putamen_basal
rs13248070 8 27985498 ELP3 ENSG00000134014.12 7.325 e - 0.01 38308年 gtex_brain_putamen_basal
rs13250007 8 27995722 ELP3 ENSG00000134014.12 8.658 e - 0.01 48532年 gtex_brain_putamen_basal

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0003677 DNA结合 艾达 11714725
去:0005506 铁离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0005515 蛋白结合 新闻学会 11714725
去:0004402 组蛋白乙酰转移酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0016740 转移酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0008607 磷酸化酶激酶调节活动 艾达 11818576
去:0008415 酰基转移酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0008080 N-acetyltransferase活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0016944 RNA聚合酶II转录延长因子活动 艾达 11714725
去:0046872 金属离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0051536 iron-sulfur集群绑定 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006357 监管RNA聚合酶II启动子的转录 艾达 11818576
去:0006350 转录 国际能源机构 - - - - - -
去:0008152 代谢过程 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005634 国际能源机构 - - - - - -
去:0005730 核仁 艾达 11714725
去:0005737 细胞质 艾达 11818576
去:0008023 转录延长因子复杂 艾达 11818576
去:0016591 DNA-directed RNA聚合酶II,全酶 艾达 11714725

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
CASORELLI急性早幼粒细胞白血病DN 663年 425年 所有SZGR 2.0基因通路
多德鼻咽癌DN 1375年 806年 所有SZGR 2.0基因通路
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 1781年 1082年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH自行车基因 648年 385年 所有SZGR 2.0基因通路
伊万诺娃早期造血祖 532年 309年 所有SZGR 2.0基因通路
马森FOXP3如果绑定 1229年 713年 所有SZGR 2.0基因通路
ACEVEDO肝癌DN 540年 340年 所有SZGR 2.0基因通路
KYNG WERNER通气和正常老化 93年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
WHITFIELD细胞周期G1 148年 95年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 410 389年 395年 1 hsa - mir - 410 AAUAUAACACAGAUGGCCUGU