基因页面:ELP3
总结吗?
GeneID | 55140年 |
象征 | ELP3 |
同义词 | KAT9 |
描述 | 延伸机乙酰转移酶复合体亚基3 |
参考 | MIM: 612722|HGNC: HGNC: 20696|运用:ENSG00000134014|HPRD: 10936|织女:OTTHUMG00000102124 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 8 p21.1 |
帕斯卡假定值 | 0.019 |
夏洛克假定值 | 0.852 |
胎儿β | -0.092 |
eGene | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马体 下丘脑 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 元 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.031 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.03086 | |
GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.00057 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs13251987 | 8 | 27935535 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 1.011 e-6 | 0.01 | -11655年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs397715561 | 8 | 27938863 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 2.805 e-6 | 0.01 | -8327年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs35221601 | 8 | 27946015 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 1.08 e-6 | 0.01 | -1175年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1377338 | 8 | 27946373 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 1.048 e-6 | 0.01 | -817年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs4732816 | 8 | 27947607 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 1.84 e-6 | 0.01 | 417年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs11779927 | 8 | 27947787 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 8.521 e - | 0.01 | 597年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs201756860 | 8 | 27947992 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 3.962 e-6 | 0.01 | 802年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs34247390 | 8 | 27948535 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 5.704 e - | 0.01 | 1345年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs28507502 | 8 | 27950008 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 5.081 e - | 0.01 | 2818年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2305452 | 8 | 27950535 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 7.093 e - | 0.01 | 3345年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2305451 | 8 | 27950670 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 7.114 e - | 0.01 | 3480年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs11786004 | 8 | 27951025 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 1.913 e-6 | 0.01 | 3835年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs13261052 | 8 | 27953876 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 1.944 e-6 | 0.01 | 6686年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1563055 | 8 | 27954465 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 1.907 e-6 | 0.01 | 7275年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2290371 | 8 | 27957313 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 5.029 e - | 0.01 | 10123年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs4732820 | 8 | 27963212 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 7.623 e - | 0.01 | 16022年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs4732822 | 8 | 27969805 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 5.165 e - | 0.01 | 22615年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs34460067 | 8 | 27982152 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 5.165 e - | 0.01 | 34962年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs12548838 | 8 | 27982954 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 5.876 e - | 0.01 | 35764年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs13248070 | 8 | 27985498 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 7.325 e - | 0.01 | 38308年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs13250007 | 8 | 27995722 | ELP3 | ENSG00000134014.12 | 8.658 e - | 0.01 | 48532年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ELP3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003677 | DNA结合 | 艾达 | 11714725 | |
去:0005506 | 铁离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 11714725 | |
去:0004402 | 组蛋白乙酰转移酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016740 | 转移酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008607 | 磷酸化酶激酶调节活动 | 艾达 | 11818576 | |
去:0008415 | 酰基转移酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008080 | N-acetyltransferase活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016944 | RNA聚合酶II转录延长因子活动 | 艾达 | 11714725 | |
去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0051536 | iron-sulfur集群绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006357 | 监管RNA聚合酶II启动子的转录 | 艾达 | 11818576 | |
去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008152 | 代谢过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 11714725 | |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 11818576 | |
去:0008023 | 转录延长因子复杂 | 艾达 | 11818576 | |
去:0016591 | DNA-directed RNA聚合酶II,全酶 | 艾达 | 11714725 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
CASORELLI急性早幼粒细胞白血病DN | 663年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH自行车基因 | 648年 | 385年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃早期造血祖 | 532年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝癌DN | 540年 | 340年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KYNG WERNER通气和正常老化 | 93年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WHITFIELD细胞周期G1 | 148年 | 95年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 410 | 389年 | 395年 | 1 | hsa - mir - 410 | AAUAUAACACAGAUGGCCUGU |