基因页面:MSTO1
总结吗?
GeneID | 55154年 |
象征 | MSTO1 |
同义词 | LST005 | MST |
描述 | 也陆陆续续1,线粒体分布和形态 |
参考 | HGNC: HGNC: 29678|运用:ENSG00000125459|HPRD: 16904|织女:OTTHUMG00000014014 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 1的时候 |
夏洛克假定值 | 0.545 |
胎儿β | -0.144 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 小脑 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 1 |
GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0235 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.00814 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg15696781 | 1 | 153847021 | MSTO1 | -0.03 | 0.3 | DMG: Nishioka_2013 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs1749409 | chr1 | 155870415 | MSTO1 | 55154年 | 0.09 | 独联体 | ||
rs605025 | chr1 | 155887771 | MSTO1 | 55154年 | 0.01 | 独联体 | ||
rs17234657 | chr5 | 40401508 | MSTO1 | 55154年 | 0.07 | 反式 | ||
rs7940340 | chr11 | 76334816 | MSTO1 | 55154年 | 0.17 | 反式 | ||
rs4818674 | chr21 | 23697152 | MSTO1 | 55154年 | 0.14 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MSTO1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003674 | molecular_function | ND | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0048311 | 线粒体分布 | 小鬼 | 17349998 | |
去:0051258 | 蛋白质聚合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 11256614 | |
去:0005739 | 线粒体 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005741 | 线粒体外膜 | 艾达 | 17349998 | |
去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0043234 | 蛋白质复合体 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
DN HORIUCHI WTAP目标 | 310年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GINESTIER乳腺癌ZNF217放大DN | 335年 | 193年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN SENESE HDAC3目标 | 536年 | 332年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
帕蒂尔肝癌 | 747年 | 453年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿塞维多甲基化在肝癌DN | 940年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
詹多发性骨髓瘤惠普DN | 47 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 | 898年 | 516年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PURBEY CTBP1和SATB1 DN的目标 | 180年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG RXRA 8 d | 882年 | 506年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |