基因页:SHQ1
概括?
基因 | 55164 |
象征 | SHQ1 |
同义词 | Grim-1 | SHQ1P |
描述 | SHQ1,H/ACA核糖核蛋白组装因子 |
参考 | MIM:613663|HGNC:HGNC:25543|ENSEMBL:ENSG00000144736|HPRD:07682|Vega:Otthumg00000158814 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P13 |
Pascal P值 | 0.73 |
Sherlock P值 | 0.774 |
胎儿β | -0.384 |
主持人 | 小脑半球 额叶皮质BA9 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.04359 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.04047 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SHQ1 | CHR3 | 72842102 | G | 一个 | NM_018130 | 。 | 沉默的 | 精神分裂症 | DNM:Gulsuner_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SHQ1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mattioli Mgus vs PCL | 116 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mattioli mgus vs多发性骨髓瘤 | 16 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
山乳房干细胞DN | 146 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |