概括
基因 55164
象征 SHQ1
同义词 Grim-1 | SHQ1P
描述 SHQ1,H/ACA核糖核蛋白组装因子
参考 MIM:613663|HGNC:HGNC:25543|ENSEMBL:ENSG00000144736|HPRD:07682|Vega:Otthumg00000158814
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P13
Pascal P值 0.73
Sherlock P值 0.774
胎儿β -0.384
主持人 小脑半球
额叶皮质BA9

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.04359
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.04047

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
SHQ1 CHR3 72842102 G 一个 NM_018130 沉默的 精神分裂症 DNM:Gulsuner_2013


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mattioli Mgus vs PCL 116 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mattioli mgus vs多发性骨髓瘤 16 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
山乳房干细胞DN 146 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因