基因页:RNMTL1
概括?
基因 | 55178 |
象征 | RNMTL1 |
同义词 | MRM3 | RMTL1 |
描述 | RNA甲基转移酶像1 |
参考 | MIM:612600|HGNC:HGNC:18485|ENSEMBL:ENSG00000171861|HPRD:15266|Vega:Otthumg0000000090285 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17p13.3 |
Pascal P值 | 0.033 |
Sherlock P值 | 0.033 |
胎儿β | -0.503 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17019396 | CHR3 | 2763878 | RNMTL1 | 55178 | 0.03 | 反式 | ||
RS7327057 | CHR13 | 55133036 | RNMTL1 | 55178 | 0.03 | 反式 | ||
RS4318463 | CHR21 | 27032814 | RNMTL1 | 55178 | 0.05 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RNMTL1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤分化中等程度与不良 | 121 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦卡因可卡因奖励5D | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |