概括
基因 55206
象征 SBNO1
同义词 mop3 | sno
描述 草莓凹槽同源1(果蝇)
参考 MIM:614274|HGNC:HGNC:22973|Ensembl:ENSG00000139697|HPRD:11533|Vega:Otthumg00000183988
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12Q24.31
Pascal P值 1.018E-9
胎儿β 0.89
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Girard_2011 整个外显子组测序分析 数据集包括从14个精神分裂症概率及其父母的外部发现的15个DNM。
LK:是的 全基因组协会研究 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV:RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
SBNO1 CHR12 123804988 G C NM_001167856
NM_018183
p.886n> k
p.885n> k
错过
错过
精神分裂症 DNM:Girard_2011


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
钟对偶氮替丁的反应和tsa 183 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘vmyb的目标 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans 185 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DORSAM HOXA9靶向DN 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jazaeri乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 DN 43 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由组蛋白乙酰化调节的玛丽亚达森 83 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sharma毛囊星形胶质细胞瘤位置 25 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 275 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因