基因页：arl8b
概括？
| 基因 | 55207 |
| 象征 | arl8b |
| 同义词 | ARL10C | Gie1 |
| 描述 | ADP核糖基化因子，例如GTPase 8B |
| 参考 | MIM：616596|HGNC：HGNC：25564|ENSEMBL：ENSG00000134108|HPRD：12483|Vega：Otthumg0000000090463 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3P26.1 |
| Pascal P值 | 0.108 |
| Sherlock P值 | 0.263 |
| 胎儿β | -1.816 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑 皮质 海马 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 |
| 支持 | 细胞内贩运 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 1 |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.066 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG03223878 | 3 | 5021310 | arl8b | 0.003 | -6.044 | DMG：Vaneijk_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4499578 | 3 | 5167618 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.464E-6 | 0.01 | 3713 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62253635 | 3 | 5167997 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.464E-6 | 0.01 | 4092 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11926551 | 3 | 5168519 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.462E-6 | 0.01 | 4614 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11710829 | 3 | 5170332 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.517E-6 | 0.01 | 6427 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS57459025 | 3 | 5170865 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.464E-6 | 0.01 | 6960 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11915596 | 3 | 5170906 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.464E-6 | 0.01 | 7001 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS35833834 | 3 | 5171872 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.751E-6 | 0.01 | 7967 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS200932490 | 3 | 5173073 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.419E-6 | 0.01 | 9168 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62253640 | 3 | 5173774 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.465E-6 | 0.01 | 9869 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS13062913 | 3 | 5173799 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.798E-6 | 0.01 | 9894 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS13072454 | 3 | 5174223 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 8.797E-7 | 0.01 | 10318 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS13072633 | 3 | 5174332 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.798E-6 | 0.01 | 10427 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS34287764 | 3 | 5174786 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 8.799E-7 | 0.01 | 10881 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS35393423 | 3 | 5174908 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 9.195E-7 | 0.01 | 11003 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11719986 | 3 | 5175530 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 8.774E-7 | 0.01 | 11625 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS5846363 | 3 | 5178445 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.582E-6 | 0.01 | 14540 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11720410 | 3 | 5183861 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 7.975E-7 | 0.01 | 19956 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7633347 | 3 | 5184779 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 7.873E-7 | 0.01 | 20874 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS56778477 | 3 | 5186772 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 6.323E-7 | 0.01 | 22867 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS55948235 | 3 | 5187031 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 3.789E-7 | 0.01 | 23126 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS398091250 | 3 | 5187512 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 8.388e-7 | 0.01 | 23607 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11921280 | 3 | 5188195 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 7.934e-7 | 0.01 | 24290 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11918654 | 3 | 5188246 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 7.934e-7 | 0.01 | 24341 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11929290 | 3 | 5188432 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 7.881E-7 | 0.01 | 24527 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS55946647 | 3 | 5188814 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 3.606E-7 | 0.01 | 24909 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11710312 | 3 | 5189234 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 3.656E-7 | 0.01 | 25329 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11710404 | 3 | 5189539 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 3.615E-7 | 0.01 | 25634 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3864060 | 3 | 5189592 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 7.187E-7 | 0.01 | 25687 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11714002 | 3 | 5189701 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 7.544e-7 | 0.01 | 25796 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11706544 | 3 | 5189899 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 7.505E-7 | 0.01 | 25994 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11711365 | 3 | 5189979 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 7.476E-7 | 0.01 | 26074 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS57213835 | 3 | 5190000 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 3.585e-7 | 0.01 | 26095 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11707685 | 3 | 5191756 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 2.285E-7 | 0.01 | 27851 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS9713188 | 3 | 5192139 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 4.01E-7 | 0.01 | 28234 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3967124 | 3 | 5192194 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 2.023e-7 | 0.01 | 28289 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS35108357 | 3 | 5192549 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 2.642E-7 | 0.01 | 28644 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS200429478 | 3 | 5192551 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 2.792E-7 | 0.01 | 28646 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4054852 | 3 | 5192552 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 4.087E-7 | 0.01 | 28647 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4266178 | 3 | 5192553 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 7.764e-7 | 0.01 | 28648 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12497542 | 3 | 5193541 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 9.177E-7 | 0.01 | 29636 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS60416950 | 3 | 5194437 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 7.873E-7 | 0.01 | 30532 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10428135 | 3 | 5195080 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.638E-7 | 0.01 | 31175 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10428151 | 3 | 5195655 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.55e-7 | 0.01 | 31750 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3899068 | 3 | 5196050 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.563E-7 | 0.01 | 32145 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS34477772 | 3 | 5196058 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 3.43e-7 | 0.01 | 32153 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3967123 | 3 | 5196406 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.554E-7 | 0.01 | 32501 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4054850 | 3 | 5196508 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.549E-7 | 0.01 | 32603 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6798707 | 3 | 5196639 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.421E-7 | 0.01 | 32734 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6798806 | 3 | 5196707 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 3.43e-7 | 0.01 | 32802 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS56215613 | 3 | 5197318 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 2.257E-7 | 0.01 | 33413 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS13068579 | 3 | 5198524 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 2.004e-7 | 0.01 | 34619 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11927499 | 3 | 5199198 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 3.476E-7 | 0.01 | 35293 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62255880 | 3 | 5199351 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.405E-6 | 0.01 | 35446 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS60724392 | 3 | 5199858 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.387E-6 | 0.01 | 35953 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6787725 | 3 | 5201054 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.435E-7 | 0.01 | 37149 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS13093192 | 3 | 5201615 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 2.004e-7 | 0.01 | 37710 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS13093380 | 3 | 5201723 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 2.004e-7 | 0.01 | 37818 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11708037 | 3 | 5201815 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.547E-7 | 0.01 | 37910 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS60842168 | 3 | 5202445 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 3.426E-7 | 0.01 | 38540 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7614778 | 3 | 5202793 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.989E-7 | 0.01 | 38888 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS73807499 | 3 | 5202992 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.547E-7 | 0.01 | 39087 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11130291 | 3 | 5203776 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 9.86e-8 | 0.01 | 39871 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6803009 | 3 | 5210178 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.991E-7 | 0.01 | 46273 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS59478365 | 3 | 5211256 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 5.183E-7 | 0.01 | 47351 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6764910 | 3 | 5211390 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 2.004e-7 | 0.01 | 47485 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3856889 | 3 | 5212903 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 9.86e-8 | 0.01 | 48998 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2270750 | 3 | 5214126 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 3.503E-7 | 0.01 | 50221 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7614298 | 3 | 5219198 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 1.373E-7 | 0.01 | 55293 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS59759123 | 3 | 5222488 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 3.456e-7 | 0.01 | 58583 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS455832 | 3 | 5225783 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 5.558e-7 | 0.01 | 61878 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6765898 | 3 | 5227663 | arl8b | ENSG00000134108.8 | 9.41E-7 | 0.01 | 63758 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0003924 | GTPase活性 | nas | 15331635 | |
| 去：0005525 | GTP结合 | 艾达 | 15331635 | |
| 去：0019003 | GDP结合 | 艾达 | 15331635 | |
| 去：0043014 | α-微管蛋白结合 | 艾达 | 15331635 | |
| GO：0048487 | β-微管蛋白结合 | 艾达 | 15331635 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007264 | 小GTPase介导的信号转导 | IEA | - | |
| 去：0007059 | 染色体分离 | 小鬼 | 14871887 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 15331635 | |
| 去：0005765 | 溶酶体膜 | IEA | - | |
| 去：0005768 | 内体 | IEA | - | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| 去：0030496 | 中体 | 艾达 | 15331635 | |
| GO：0051233 | 纺锤体中区 | 艾达 | 15331635 | |
| GO：0031902 | 内体膜晚期 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Laiho结直肠癌锯齿状 | 112 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼肿瘤分化了井和DN不良 | 382 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼肿瘤分化中等程度与不良 | 121 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江缺氧癌 | 83 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jepsen SMRT目标 | 33 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇7的时间反应7 | 76 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-103/107 | 917 | 923 | 1a | HSA-MIR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
| HSA-MIR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
| mir-124.1 | 1492 | 1498 | 1a | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| mir-128 | 1358 | 1364 | M8 | HSA-MIR-128A | ucacagugaaccggucuuuu |
| HSA-MIR-128B | ucacagugaaccggucuuc | ||||
| mir-148/152 | 133 | 139 | M8 | HSA-MIR-148A | ucagugcacuacaacuuugu |
| HSA-MIR-152脑 | UCAGUGCAUGACACUUGGG | ||||
| HSA-MIR-148B | ucagugcaucacacaacuuugu | ||||
| mir-15/16/195/424/497 | 914 | 920 | M8 | HSA-MIR-15A脑 | uagcagcacauaugguugug |
| HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
| HSA-MIR-15B脑 | uagcagcacaucaugguuaca | ||||
| HSA-MIR-195SZ | uagcagaaaaauauuggc | ||||
| HSA-MIR-424 | Cagcagcaauucauguuuugaa | ||||
| HSA-MIR-497 | cagcagcacacuguguuugu | ||||
| mir-19 | 1528年 | 1534年 | 1a | HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga |
| HSA-MIR-19B | ugugcaaauccaugcaaaacuga | ||||
| MiR-200BC/429 | 450 | 456 | M8 | HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac |
| HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
| HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu | ||||
| mir-204/211 | 1259 | 1265 | M8 | HSA-MIR-204脑 | Uucccuuugucauccuaugccu |
| HSA-MIR-211 | uucccuuugucauccuucgccu | ||||
| mir-214 | 137 | 143 | 1a | HSA-MIR-214脑 | acagcaggcacagacaggcag |
| mir-218 | 974 | 980 | 1a | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
| mir-23 | 1909年 | 1915年 | 1a | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
| HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
| HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc | ||||
| HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
| mir-30-5p | 1984 | 1990 | M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
| HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
| HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
| HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
| HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
| mir-320 | 2000 | 2007 | 1A，M8 | HSA-MIR-320 | aaaagcugggugagaggggcgaa |
| mir-34/449 | 1483 | 1489 | 1a | HSA-MIR-34A脑 | uggcaguguuaguguguuuu |
| HSA-MIR-34C | Aggcaguguaguagcugauugc | ||||
| HSA-MIR-449 | uggcaguguauuguagcuggu | ||||
| HSA-MIR-449B | Aggcaguguauuguuagcuggc | ||||
| mir-377 | 1363 | 1369 | M8 | HSA-MIR-377 | aucacacaaaggaacuuuuugu |
| mir-433-3p | 2062 | 2068 | M8 | HSA-MIR-433脑 | aucaugauggggcuccucggugu |
| mir-539 | 123 | 130 | 1A，M8 | HSA-MIR-539 | ggagaauuauccuuggugugu |
| mir-7 | 14 | 21 | 1A，M8 | HSA-MIR-7SZ | Uggaagacuaguuuuuguug |