基因页：PPP2R2B
概括？
| 基因 | 5521 |
| 象征 | PPP2R2B |
| 同义词 | b55beta | pp2ab55beta | pp2abbeta | pp2apr55b | pp2apr55beta | pr2ab555beta | pr2abbeta | pr2apr555beta | pr52b | pr52b | pr55beta | pr55beta | pr555beta | sca12 | sca12 | sca12 |
| 描述 | 蛋白质磷酸酶2调节亚基B，β |
| 参考 | MIM：604325|HGNC：HGNC：9305|ENSEMBL：ENSG00000156475|HPRD：05059|Vega：Otthumg00000163381 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5Q32 |
| Pascal P值 | 5.413e-5 |
| Sherlock P值 | 0.621 |
| 胎儿β | 0.6 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0032 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00459 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01718 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MPO | 0.81 | 0.21 |
| PRTN3 | 0.67 | 0.08 |
| Elane | 0.62 | 0.08 |
| KLK10 | 0.61 | 0.08 |
| CBLN1 | 0.60 | 0.18 |
| LMO1 | 0.60 | 0.11 |
| ZNF385C | 0.57 | 0.20 |
| RNase2 | 0.56 | 0.22 |
| UTF1 | 0.55 | -0.12 |
| podnl1 | 0.53 | 0.14 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| BCl2L2 | -0.20 | -0.32 |
| ORAOV1 | -0.19 | -0.22 |
| TRIM41 | -0.18 | -0.29 |
| 黑手党 | -0.18 | -0.26 |
| HDAC11 | -0.18 | -0.33 |
| 9月8日 | -0.17 | -0.32 |
| tchh | -0.17 | -0.25 |
| KLHL3 | -0.17 | -0.24 |
| synm | -0.17 | -0.23 |
| MAP7 | -0.17 | -0.32 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0008601 | 蛋白质磷酸酶2A调节剂活性 | 塔斯 | 1849734 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008219 | 细胞死亡 | IEA | - | |
| 去：0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000159 | 蛋白质磷酸酶2a型复合物 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg thright连接点 | 134 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta Chrebp2途径 | 42 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID ATR途径 | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID PDGFRB途径 | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9 Fusion 10D DN的Takeda目标 | 142 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1和HDAC2靶向DN | 232 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC2靶向DN | 133 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿比·lif信号2向上 | 14 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 康（Kang）由tert dn永生 | 102 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein Medulla标记 | 81 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA损坏4NQO或UV | 63 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ISSAEVA MLL2目标 | 62 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-129-5p | 412 | 418 | 1a | HSA-MIR-129脑 | cuuuuugcgguggggcuugc |
| HSA-MIR-129-5P | cuuuuugcgguggggcuugcu | ||||