基因页：RCBTB1
概括？
| 基因 | 55213 |
| 象征 | RCBTB1 |
| 同义词 | clld7 | clll7 | glp |
| 描述 | RCC1和BTB结构域含有蛋白质1 |
| 参考 | MIM：607867|HGNC：HGNC：18243|ENSEMBL：ENSG00000136144|HPRD：09713|Vega：Otthumg0000000016915 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 13Q14 |
| Pascal P值 | 0.017 |
| DEG P值 | DEG：Maycox_2009：cc_ba10_fold_change = 1.10：cc_ba10_disease_p = 0.0455：hbb_ba9_fold_change = 1.15：hbb_ba9_disease_p = 0.0301 |
| 胎儿β | -0.186 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 皮质 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DEG：Maycox_2009 | 微阵列确定验尸后30000多个mRNA转录本的表达 | 我们包括了51个基因，其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。 | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG00852613 | 13 | 50159829 | RCBTB1 | 2.21E-6 | -0.39 | 0.008 | DMG：Wockner_2014 |
| CG17487741 | 13 | 50107026 | RCBTB1 | 3.353E-4 | -0.35 | 0.041 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| 去：0006350 | 转录 | IEA | - | |
| 去：0007049 | 细胞周期 | IEA | - | |
| GO：0016568 | 染色质修饰 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 11256614 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Laiho结直肠癌锯齿状DN | 86 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hummel Burkitts淋巴瘤 | 43 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇1 DN | 378 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TCGA胶质母细胞瘤副本编号DN | 31 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗斯急性髓样白血病CBF | 82 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ROSS AML与AML1 ETO融合 | 76 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HADDAD B淋巴细胞祖细胞 | 293 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAL PRMT5靶向 | 203 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chuang氧化应激反应向上 | 28 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| safford t淋巴细胞厌食 | 87 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林黑色素瘤副本编号DN | 41 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ruiz TNC目标 | 153 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-145 | 2086 | 2092 | 1a | HSA-MIR-145 | guccaguuucccaggaaucccuu |
| mir-218 | 1753年 | 1760年 | 1A，M8 | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
| mir-26 | 1729年 | 1736年 | 1A，M8 | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
| HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||