基因页面:PPP2R2C
总结吗?
| GeneID | 5522年 |
| 象征 | PPP2R2C |
| 同义词 | B55-GAMMA | IMYPNO | IMYPNO1 | PR52 | PR55G |
| 描述 | 蛋白磷酸酶2调节亚基B,γ |
| 参考 | MIM: 605997|HGNC: HGNC: 9306|运用:ENSG00000074211|HPRD: 09345|织女:OTTHUMG00000090445 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 4 p16.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.135 |
| 夏洛克假定值 | 0.163 |
| 胎儿β | -1.528 |
| 支持 | CompositeSet 达内尔FMRP目标 |
基因数据来源
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FXYD7 | 0.56 | 0.56 |
| YPEL3 | 0.56 | 0.57 |
| RFPL2 | 0.56 | 0.57 |
| YPEL4 | 0.55 | 0.59 |
| P4HTM | 0.54 | 0.57 |
| HMOX2 | 0.54 | 0.55 |
| MPI | 0.53 | 0.53 |
| MRPS25 | 0.53 | 0.55 |
| ADC | 0.52 | 0.55 |
| C6orf136 | 0.52 | 0.54 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.18 | -0.31 | -0.16 |
| AF347015.21 | -0.28 | -0.16 |
| MT-ATP8 | -0.27 | -0.12 |
| ANP32C | -0.25 | -0.28 |
| RP11-3P17.1 | -0.25 | -0.26 |
| AF347015.2 | -0.24 | -0.09 |
| IL32 | -0.24 | -0.20 |
| EDN1 | -0.24 | -0.06 |
| CD248 | -0.24 | -0.23 |
| FAM159B | -0.24 | -0.30 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0008601 | 蛋白磷酸酶2型监管机构的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008601 | 蛋白磷酸酶2型监管机构的活动 | NAS | 10945473 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007165 | 信号转导 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007165 | 信号转导 | NAS | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0000159 | 蛋白磷酸酶2型复杂 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0000159 | 蛋白磷酸酶2型复杂 | NAS | 10945473 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ARL2 | ARFL2 | ADP-ribosylation因子2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12912990 |
| CCT2 | 99年d8.1 |设计CCT-beta | CCTB | MGC142074 | MGC142076 | PRO1633 | TCP-1-beta | 包含TCP1 chaperonin,亚基2(β) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| CCT3 | CCT-gamma | CCTG | PIG48 | TCP-1-gamma | TRIC5 | 包含TCP1 chaperonin,亚基3(γ) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| CCT4 | CCT-DELTA | Cctd | MGC126164 | MGC126165 | SRB | 包含TCP1 chaperonin,亚基4(δ) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| CCT5 | CCT-epsilon | CCTE | KIAA0098 | TCP-1-epsilon | 包含TCP1 chaperonin,亚基5(ε) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| CCT6A | CCT-zeta | CCT-zeta-1 | CCT6 | Cctz | HTR3 | MGC126214 | MGC126215 | MoDP-2 | TCP-1-zeta | TCP20 | TCPZ | TTCP20 | 6包含TCP1 chaperonin,亚基(ζ1) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| CCT7 | CCT-ETA | Ccth | MGC110985 | Nip7-1 | TCP-1-eta | 包含TCP1 chaperonin,亚基7 (eta) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| CCT8 | C21orf112 | Cctq | D21S246 | KIAA0002 | PRED71 | 包含TCP1 chaperonin,亚基8(θ) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| PPP2CA | PP2Ac | PP2CA | RP-C | 蛋白磷酸酶2(原2 a),催化亚基、α同种型 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| PPP2R1A | MGC786 | PR65A | 蛋白磷酸酶2(原2 A),调节亚基,α同种型 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| PPP2R1B | MGC26454 | PR65B | 蛋白磷酸酶2(原2 A),调节亚基,β同种型 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| RAF1 | CRAF | NS5 | Raf-1 | c-Raf | v-raf-1小鼠白血病病毒致癌基因同族体1 | RAF1 (c-Raf)与一个未指明的同种型的PPP2R2C (PP2A-C)。 | 绑定 | 16041367 |
| TCP1 | CCT-alpha | CCT1 | CCTa | D6S230E | TCP-1-alpha | t-complex 1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG紧密连接 | 134年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA CHREBP2通路 | 42 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHARAFE乳腺癌导管和基地 | 380年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王食道癌和正常的DN | 101年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佩雷斯TP63目标 | 355年 | 243年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佩雷斯TP53和TP63目标 | 205年 | 145年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼肿瘤分化和适度DN | 110年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 小山SEMA3B DN的目标 | 411年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 鲜明的前额叶皮层22 q11删除 | 195年 | 138年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 酒井法子肿瘤浸润的单核细胞DN | 81年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃造血干细胞和祖 | 681年 | 420年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 藤井裕久YBX1 DN的目标 | 202年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 损害阻力BCL2抑制剂 | 36 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿塞维多甲基化在肝癌DN | 940年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YAUCH刺猬信号旁分泌DN | 264年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳人大HCP H3K4ME2和H3K27ME3 | 349年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大HCP H3K27ME3 | 341年 | 243年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 福斯特KDM1A目标了 | 266年 | 142年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 194 | 2708年 | 2714年 | 1 | hsa - mir - 194 | UGUAACAGCAACUCCAUGUGGA |
| mir - 200 bc / 429 | 1870年 | 1877年 | 1、m8 | hsa - mir - 200 b | UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC |
| hsa - mir - 200 c | UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG | ||||
| hsa - mir - 429 | UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU | ||||
| mir - 218 | 1736年 | 1743年 | 1、m8 | hsa - mir - 218大脑 | UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU |
| mir - 320 | 2683年 | 2689年 | m8 | hsa - mir - 320 | AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA |
| mir - 369 - 3 - p | 1872年 | 1879年 | 1、m8 | hsa - mir - 369 - 3 - p | AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU |
| mir - 374 | 1873年 | 1879年 | m8 | hsa - mir - 374 | UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG |
| mir - 493 - 5 - p | 1879年 | 1885年 | m8 | hsa - mir - 493 - 5 - p | UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU |
| mir - 505 | 2653年 | 2659年 | 1 | hsa - mir - 505 | GUCAACACUUGCUGGUUUCCUC |
| mir - 543 | 2706年 | 2712年 | 1 | hsa - mir - 543 | AAACAUUCGCGGUGCACUUCU |
| hsa - mir - 543 | AAACAUUCGCGGUGCACUUCU | ||||