基因页面:RAVER2
总结吗?
| GeneID | 55225年 |
| 象征 | RAVER2 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 核糖核蛋白,PTB-binding 2 |
| 参考 | MIM: 609953|HGNC: HGNC: 25577|运用:ENSG00000162437|HPRD: 11154|织女:OTTHUMG00000009102 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 1 p31.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.05 |
| 夏洛克假定值 | 0.713 |
| 胎儿β | 0.462 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.02692 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs17542055 | chr7 | 42652803 | RAVER2 | 55225年 | 0.19 | 反式 | ||
| rs9508068 | chr13 | 29153859 | RAVER2 | 55225年 | 0.08 | 反式 | ||
| rs284907 | chr15 | 76741568 | RAVER2 | 55225年 | 0.18 | 反式 | ||
| rs284904 | chr15 | 76744301 | RAVER2 | 55225年 | 0.12 | 反式 | ||
| rs284898 | chr15 | 76750694 | RAVER2 | 55225年 | 0.03 | 反式 | ||
| rs157768 | chr15 | 76833778 | RAVER2 | 55225年 | 0.1 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003723 | 核糖核酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 刘前列腺癌DN | 481年 | 290年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王CLIM2目标了 | 269年 | 146年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| JAATINEN造血干细胞 | 316年 | 190年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 徐gh自分泌目标DN | 142年 | 94年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 《图片报》E2F3致癌签名 | 246年 | 153年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 丰田MIR34B和MIR34C的目标 | 463年 | 262年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳人大HCP H3K4ME2 | 491年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BILANGES血清敏感基因 | 90年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BILANGES血清反应翻译 | 37 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| let-7/98 | 1290年 | 1296年 | 1 | hsa-let-7a大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU |
| hsa-let-7b大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU | ||||
| hsa-let-7c大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU | ||||
| hsa-let-7d大脑 | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU | ||||
| hsa-let-7e大脑 | UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU | ||||
| hsa-let-7f大脑 | UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU | ||||
| hsa - mir - 98大脑 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU | ||||
| hsa-let-7g深圳 | UGAGGUAGUAGUUUGUACAGU | ||||
| hsa-let-7i大脑 | UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU | ||||
| mir - 124.1 | 60 | 67年 | 1、m8 | hsa - mir - 124 a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| miR-124/506 | 60 | 66年 | 1 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir - 135 | 81年 | 87年 | 1 | hsa - mir - 135 a | UAUGGCUUUUUAUUCCUAUGUGA |
| hsa - mir - 135 b | UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG | ||||
| mir - 137 | 322年 | 329年 | 1、m8 | hsa - mir - 137 | UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG |
| hsa - mir - 137 | UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG | ||||
| mir - 448 | 2235年 | 2241年 | m8 | hsa - mir - 448 | UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU |
| miR-99/100 | 97年 | 103年 | m8 | hsa - mir - 99 a大脑 | AACCCGUAGAUCCGAUCUUGUG |
| hsa - mir - 100大脑 | AACCCGUAGAUCCGAACUUGUG | ||||
| hsa - mir - 99 b大脑 | CACCCGUAGAACCGACCUUGCG | ||||