基因页：PPP2R5A
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| 基因ID | 5525 |
| Symbol | PPP2R5A |
| 同义词 | B56A | PR61A |
| 描述 | 蛋白质磷酸酶2调节亚基B'，α |
| 参考 | MIM:601643|HGNC：HGNC：9309|Ensembl：ENSG0000000066027|HPRD：03384|Vega：Otthumg0000000036750 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1Q32.2-Q32.3 |
| Sherlock P值 | 0.177 |
| 胎儿β | -1.091 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG13453711 | 1 | 212482804 | PPP2R5A | 5.68e-6 | 0.442 | 0.011 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS516349 | 0 | PPP2R5A | 5525 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| WDR70 | 0.95 | 0.93 |
| WTAP | 0.94 | 0.91 |
| 加特 | 0.94 | 0.91 |
| ZNF22 | 0.94 | 0.87 |
| SUV39H2 | 0.93 | 0.89 |
| ZNF738 | 0.93 | 0.88 |
| KDM1 | 0.93 | 0.88 |
| TAF1A | 0.93 | 0.85 |
| CEP57 | 0.93 | 0.89 |
| hnrnph1 | 0.93 | 0.86 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| HLA-F | -0.72 | -0.77 |
| FBXO2 | -0.71 | -0.70 |
| AIFM3 | -0.71 | -0.77 |
| AF347015.27 | -0.70 | -0.86 |
| pth1r | -0.69 | -0.75 |
| AF347015.31 | -0.69 | -0.87 |
| C5orf53 | -0.68 | -0.67 |
| MT-CO2 | -0.68 | -0.86 |
| mt-cyb | -0.68 | -0.87 |
| AF347015.33 | -0.67 | -0.85 |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| APC | BTPS2 |DP2 |DP2.5 |dp3 |GS | adenomatous polyposis coli | 共定位 | Biogrid | 11585828 |
| axin1 | Axin |MGC52315 | 轴1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 11297546 |
| BCL2 | Bcl-2 | B细胞CLL/淋巴瘤2 | - | HPRD，Biogrid | 11929874 |
| 最好的1 | arb |最好的|BMD |tu15b |VMD2 | Bestrophin 1 | - | HPRD | 12058047 |
| CSNK1A1 | CK1 |HLCDGP1 |Pro2975 | 酪蛋白激酶1，α1 | - | HPRD | 12062430 |
| CTLA4 | CD152 |celiac3 |CTLA-4 |GSE |IDDM12 | 细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4 | - | HPRD，Biogrid | 11994459 |
| EIF2AK2 | EIF2AK1 |MGC126524 |PKR |prkr | 真核翻译起始因子2-α激酶2 | - | HPRD，Biogrid | 10866685 |
| JAK2 | JTK10 | Janus激酶2（蛋白酪氨酸激酶） | - | HPRD | 8702385 |
| PPP2CA | pp2ac |pp2ca |RP-C | 蛋白质磷酸酶2（以前为2A），催化亚基，α同工型 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 18782753 |
| PPP2R1A | MGC786 |Pr65a | 蛋白质磷酸酶2（以前为2A），调节亚基A，α同工型 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 12370081|18782753 |
| ppp2r1b | MGC26454 |PR65B | 蛋白质磷酸酶2（以前为2A），调节亚基A，β同工型 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 12370081|18782753 |
| PPP2R5C | B56G |MGC23064 |Pr61g | 蛋白质磷酸酶2，调节亚基B'，γ同工型 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11929880 |
| SHC1 | FLJ26504 |SHC |SHCA | SHC（SRC同源性2结构域）转化蛋白1 | - | HPRD | 11884620 |