基因页:C7orf43
概括?
基因 | 55262 |
象征 | C7orf43 |
同义词 | - |
描述 | 染色体7开放阅读框43 |
参考 | HGNC:HGNC:25604|ENSEMBL:ENSG00000146826|HPRD:07716|Vega:Otthumg00000154862 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7Q22.1 |
Pascal P值 | 0.17 |
Sherlock P值 | 0.264 |
DEG P值 | DEG:Maycox_2009:CC_BA10_FOLD_CHANGE = -1.18:CC_BA10_DISEASE_P = 0.0182:HBB_BA9_FOLD_CHANGE = -1.52:HBB_BA9_DISEASE_P = 0.0020 |
胎儿β | -0.202 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DEG:Maycox_2009 | 微阵列确定验尸后30000多个mRNA转录本的表达 | 我们包括了51个基因,其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/C7orf43_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Doane对雄激素的反应 | 184 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ivanovska mir106b目标 | 90 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Linsley mir16目标 | 206 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |