概括
基因 55269
象征 PSPC1
同义词 PSP1
描述 拼接组件1
参考 MIM:612408|HGNC:HGNC:20320|ENSEMBL:ENSG00000121390|HPRD:10172|Vega:Otthumg0000000016502
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q12.11
Pascal P值 0.438
Sherlock P值 0.485
TADA P值 0.002
胎儿β 0.426
主持人 伏隔核基底神经节
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
PSPC1 CHR13 20304417 G 一个 NM_001042414
NR_003272
NR_044998
p.374r>*

废话
npcrna
npcrna
精神分裂症 DNM:Fromer_2014
PSPC1 CHR13 20356705 t C NM_001042414
NR_003272
NR_044998
p.65i> v

错过
npcrna
npcrna
精神分裂症 DNM:Fromer_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌20Q13扩增DN 180 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化cdc25 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性LOF DN 228 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2目标 108 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD B淋巴细胞祖细胞 293 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen Hoxa5靶向9小时 223 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPI1和FLI1的Juban目标 115 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成pparg rxra绑定36小时 152 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因