概括
基因 55276
象征 PGM2
同义词 MSTP006
描述 磷酸葡萄糖酶2
参考 MIM:172000|HGNC:HGNC:8906|Ensembl:ENSG00000169299|HPRD:11761|Vega:Otthumg0000000097813
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4P14
Pascal P值 0.01
胎儿β 0.69
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
皮质
额叶皮质BA9
海马
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节
支持 细胞代谢

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2995966 4 37780576 PGM2 ENSG00000169299.9 5.712E-7 0.02 -47679 gtex_brain_ba24
RS7659570 4 37781158 PGM2 ENSG00000169299.9 5.712E-7 0.02 -47097 gtex_brain_ba24
RS12512677 4 37817932 PGM2 ENSG00000169299.9 1.556E-6 0.02 -10323 gtex_brain_ba24
RS1115683 4 37820396 PGM2 ENSG00000169299.9 1.556E-6 0.02 -7859 gtex_brain_ba24
RS35282905 4 37821847 PGM2 ENSG00000169299.9 1.524E-6 0.02 -6408 gtex_brain_ba24
RS11721535 4 37824325 PGM2 ENSG00000169299.9 1.557E-6 0.02 -3930 gtex_brain_ba24
RS3775798 4 37824855 PGM2 ENSG00000169299.9 1.557E-6 0.02 -3400 gtex_brain_ba24
RS3756142 4 37825550 PGM2 ENSG00000169299.9 1.557E-6 0.02 -2705 gtex_brain_ba24
RS4832957 4 37825940 PGM2 ENSG00000169299.9 1.557E-6 0.02 -2315 gtex_brain_ba24
RS13122762 4 37826536 PGM2 ENSG00000169299.9 1.557E-6 0.02 -1719 gtex_brain_ba24
RS59397780 4 37827578 PGM2 ENSG00000169299.9 1.538E-6 0.02 -677 gtex_brain_ba24
RS11096905 4 37800240 PGM2 ENSG00000169299.9 5.928e-9 0 -28015 gtex_brain_putamen_basal
RS11938667 4 37800525 PGM2 ENSG00000169299.9 5.928e-9 0 -27730 gtex_brain_putamen_basal
RS66475274 4 37800876 PGM2 ENSG00000169299.9 5.928e-9 0 -27379 gtex_brain_putamen_basal
RS17578457 4 37800972 PGM2 ENSG00000169299.9 2.172E-9 0 -27283 gtex_brain_putamen_basal
RS66540038 4 37801051 PGM2 ENSG00000169299.9 2.172E-9 0 -27204 gtex_brain_putamen_basal
RS17606268 4 37801163 PGM2 ENSG00000169299.9 2.172E-9 0 -27092 gtex_brain_putamen_basal
RS11737776 4 37801348 PGM2 ENSG00000169299.9 2.172E-9 0 -26907 gtex_brain_putamen_basal
RS398107204 4 37801666 PGM2 ENSG00000169299.9 5.128e-10 0 -26589 gtex_brain_putamen_basal
RS6832381 4 37801922 PGM2 ENSG00000169299.9 2.173E-9 0 -26333 gtex_brain_putamen_basal
RS6849324 4 37801952 PGM2 ENSG00000169299.9 2.172E-9 0 -26303 gtex_brain_putamen_basal
RS11938059 4 37802139 PGM2 ENSG00000169299.9 1.188E-8 0 -26116 gtex_brain_putamen_basal
RS6849750 4 37802141 PGM2 ENSG00000169299.9 1.187E-8 0 -26114 gtex_brain_putamen_basal
RS112691053 4 37802449 PGM2 ENSG00000169299.9 5.889E-9 0 -25806 gtex_brain_putamen_basal
RS76792647 4 37802625 PGM2 ENSG00000169299.9 5.949E-9 0 -25630 gtex_brain_putamen_basal
RS13103553 4 37802850 PGM2 ENSG00000169299.9 5.908E-9 0 -25405 gtex_brain_putamen_basal
RS34371555 4 37802906 PGM2 ENSG00000169299.9 2.172E-9 0 -25349 gtex_brain_putamen_basal
RS34274238 4 37802988 PGM2 ENSG00000169299.9 2.147E-9 0 -25267 gtex_brain_putamen_basal
RS34856096 4 37803052 PGM2 ENSG00000169299.9 2.172E-9 0 -25203 gtex_brain_putamen_basal
RS13110103 4 37803233 PGM2 ENSG00000169299.9 2.172E-9 0 -25022 gtex_brain_putamen_basal
RS1425322 4 37803423 PGM2 ENSG00000169299.9 2.172E-9 0 -24832 gtex_brain_putamen_basal
RS1834340 4 37803601 PGM2 ENSG00000169299.9 2.172E-9 0 -24654 gtex_brain_putamen_basal
RS1863283 4 37803619 PGM2 ENSG00000169299.9 9.43e-9 0 -24636 gtex_brain_putamen_basal
RS5857588 4 37803623 PGM2 ENSG00000169299.9 9.373E-9 0 -24632 gtex_brain_putamen_basal
RS883270 4 37803934 PGM2 ENSG00000169299.9 2.172E-9 0 -24321 gtex_brain_putamen_basal
RS35923894 4 37804347 PGM2 ENSG00000169299.9 2.29e-6 0 -23908 gtex_brain_putamen_basal
RS1425321 4 37804819 PGM2 ENSG00000169299.9 9.43e-9 0 -23436 gtex_brain_putamen_basal
RS56838577 4 37807521 PGM2 ENSG00000169299.9 4.54e-9 0 -20734 gtex_brain_putamen_basal
RS12499691 4 37807681 PGM2 ENSG00000169299.9 5.339E-9 0 -20574 gtex_brain_putamen_basal
RS4832955 4 37809773 PGM2 ENSG00000169299.9 6.589E-9 0 -18482 gtex_brain_putamen_basal
RS1834345 4 37810182 PGM2 ENSG00000169299.9 1.644E-6 0 -18073 gtex_brain_putamen_basal
RS4832737 4 37812202 PGM2 ENSG00000169299.9 5.942e-9 0 -16053 gtex_brain_putamen_basal
RS4832738 4 37814993 PGM2 ENSG00000169299.9 5.477E-9 0 -13262 gtex_brain_putamen_basal
RS7691795 4 37816597 PGM2 ENSG00000169299.9 5.314e-9 0 -11658 gtex_brain_putamen_basal
RS4832956 4 37816879 PGM2 ENSG00000169299.9 5.294E-9 0 -11376 gtex_brain_putamen_basal
RS12512677 4 37817932 PGM2 ENSG00000169299.9 3.319E-9 0 -10323 gtex_brain_putamen_basal
RS1115683 4 37820396 PGM2 ENSG00000169299.9 3.417E-9 0 -7859 gtex_brain_putamen_basal
RS2911917 4 37820533 PGM2 ENSG00000169299.9 1.495E-6 0 -7722 gtex_brain_putamen_basal
RS34738612 4 37821794 PGM2 ENSG00000169299.9 1.244e-8 0 -6461 gtex_brain_putamen_basal
RS35282905 4 37821847 PGM2 ENSG00000169299.9 4.401E-10 0 -6408 gtex_brain_putamen_basal
RS2911910 4 37822075 PGM2 ENSG00000169299.9 1.391E-6 0 -6180 gtex_brain_putamen_basal
RS11721535 4 37824325 PGM2 ENSG00000169299.9 3.401E-9 0 -3930 gtex_brain_putamen_basal
RS3775798 4 37824855 PGM2 ENSG00000169299.9 3.598E-9 0 -3400 gtex_brain_putamen_basal
RS3756142 4 37825550 PGM2 ENSG00000169299.9 3.44e-9 0 -2705 gtex_brain_putamen_basal
RS4832957 4 37825940 PGM2 ENSG00000169299.9 3.44e-9 0 -2315 gtex_brain_putamen_basal
RS13122762 4 37826536 PGM2 ENSG00000169299.9 3.409E-9 0 -1719 gtex_brain_putamen_basal
RS59397780 4 37827578 PGM2 ENSG00000169299.9 3.413E-9 0 -677 gtex_brain_putamen_basal
RS2059483 4 37828186 PGM2 ENSG00000169299.9 4.615E-8 0 -69 gtex_brain_putamen_basal
RS3775796 4 37830358 PGM2 ENSG00000169299.9 3.261E-9 0 2103 gtex_brain_putamen_basal
RS11733779 4 37833060 PGM2 ENSG00000169299.9 3.44e-9 0 4805 gtex_brain_putamen_basal
RS3775793 4 37840606 PGM2 ENSG00000169299.9 3.44e-9 0 12351 gtex_brain_putamen_basal
RS3775792 4 37840653 PGM2 ENSG00000169299.9 3.44e-9 0 12398 gtex_brain_putamen_basal
RS12501402 4 37844504 PGM2 ENSG00000169299.9 3.447E-9 0 16249 gtex_brain_putamen_basal
RS12509391 4 37844604 PGM2 ENSG00000169299.9 3.447E-9 0 16349 gtex_brain_putamen_basal
RS398107206 4 37845833 PGM2 ENSG00000169299.9 9.457E-9 0 17578 gtex_brain_putamen_basal
RS13128974 4 37848085 PGM2 ENSG00000169299.9 3.44e-9 0 19830 gtex_brain_putamen_basal
RS35704131 4 37850312 PGM2 ENSG00000169299.9 3.448e-9 0 22057 gtex_brain_putamen_basal
RS4832959 4 37852564 PGM2 ENSG00000169299.9 3.155e-9 0 24309 gtex_brain_putamen_basal
RS6820161 4 37853172 PGM2 ENSG00000169299.9 1.043E-8 0 24917 gtex_brain_putamen_basal
RS6838455 4 37853243 PGM2 ENSG00000169299.9 1.043E-8 0 24988 gtex_brain_putamen_basal
RS6820375 4 37853268 PGM2 ENSG00000169299.9 1.046E-8 0 25013 gtex_brain_putamen_basal
RS6820384 4 37853286 PGM2 ENSG00000169299.9 1.046E-8 0 25031 gtex_brain_putamen_basal
RS13146036 4 37853375 PGM2 ENSG00000169299.9 1.043E-8 0 25120 gtex_brain_putamen_basal
RS13114137 4 37853392 PGM2 ENSG00000169299.9 1.043E-8 0 25137 gtex_brain_putamen_basal
RS13140704 4 37853407 PGM2 ENSG00000169299.9 1.033E-8 0 25152 gtex_brain_putamen_basal
RS35619511 4 37853557 PGM2 ENSG00000169299.9 1.043E-8 0 25302 gtex_brain_putamen_basal
RS6842833 4 37853661 PGM2 ENSG00000169299.9 1.043E-8 0 25406 gtex_brain_putamen_basal
RS4832960 4 37854182 PGM2 ENSG00000169299.9 1.043E-8 0 25927 gtex_brain_putamen_basal
RS4832961 4 37854327 PGM2 ENSG00000169299.9 1.043E-8 0 26072 gtex_brain_putamen_basal
RS6531582 4 37854607 PGM2 ENSG00000169299.9 1.043E-8 0 26352 gtex_brain_putamen_basal
RS6531583 4 37854693 PGM2 ENSG00000169299.9 1.043E-8 0 26438 gtex_brain_putamen_basal
RS6531584 4 37854756 PGM2 ENSG00000169299.9 1.043E-8 0 26501 gtex_brain_putamen_basal
RS6531585 4 37854827 PGM2 ENSG00000169299.9 1.043E-8 0 26572 gtex_brain_putamen_basal
RS6531586 4 37854849 PGM2 ENSG00000169299.9 1.046E-8 0 26594 gtex_brain_putamen_basal
RS6531587 4 37854911 PGM2 ENSG00000169299.9 1.046E-8 0 26656 gtex_brain_putamen_basal
RS6827984 4 37854920 PGM2 ENSG00000169299.9 1.046E-8 0 26665 gtex_brain_putamen_basal
RS11730888 4 37855550 PGM2 ENSG00000169299.9 1.334E-8 0 27295 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG糖酵解糖异生 62 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG戊糖磷酸盐途径 27 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg银乳糖代谢 26 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg淀粉和蔗糖代谢 52 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG氨基糖和核苷酸糖代谢 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖原分解糖原分解 18 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
碳水化合物的反应组代谢 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组葡萄糖代谢 69 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Myc放大靶向 201 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM2 153 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Core血清反应 212 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李最近的胸腺移民 227 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组D的UVC响应 280 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应很晚 317 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨Bcl3靶向 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因