基因页:PGM2
概括?
基因 | 55276 |
象征 | PGM2 |
同义词 | MSTP006 |
描述 | 磷酸葡萄糖酶2 |
参考 | MIM:172000|HGNC:HGNC:8906|Ensembl:ENSG00000169299|HPRD:11761|Vega:Otthumg0000000097813 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4P14 |
Pascal P值 | 0.01 |
胎儿β | 0.69 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 皮质 额叶皮质BA9 海马 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 |
支持 | 细胞代谢 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2995966 | 4 | 37780576 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 5.712E-7 | 0.02 | -47679 | gtex_brain_ba24 |
RS7659570 | 4 | 37781158 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 5.712E-7 | 0.02 | -47097 | gtex_brain_ba24 |
RS12512677 | 4 | 37817932 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.556E-6 | 0.02 | -10323 | gtex_brain_ba24 |
RS1115683 | 4 | 37820396 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.556E-6 | 0.02 | -7859 | gtex_brain_ba24 |
RS35282905 | 4 | 37821847 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.524E-6 | 0.02 | -6408 | gtex_brain_ba24 |
RS11721535 | 4 | 37824325 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.557E-6 | 0.02 | -3930 | gtex_brain_ba24 |
RS3775798 | 4 | 37824855 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.557E-6 | 0.02 | -3400 | gtex_brain_ba24 |
RS3756142 | 4 | 37825550 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.557E-6 | 0.02 | -2705 | gtex_brain_ba24 |
RS4832957 | 4 | 37825940 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.557E-6 | 0.02 | -2315 | gtex_brain_ba24 |
RS13122762 | 4 | 37826536 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.557E-6 | 0.02 | -1719 | gtex_brain_ba24 |
RS59397780 | 4 | 37827578 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.538E-6 | 0.02 | -677 | gtex_brain_ba24 |
RS11096905 | 4 | 37800240 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 5.928e-9 | 0 | -28015 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11938667 | 4 | 37800525 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 5.928e-9 | 0 | -27730 | gtex_brain_putamen_basal |
RS66475274 | 4 | 37800876 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 5.928e-9 | 0 | -27379 | gtex_brain_putamen_basal |
RS17578457 | 4 | 37800972 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 2.172E-9 | 0 | -27283 | gtex_brain_putamen_basal |
RS66540038 | 4 | 37801051 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 2.172E-9 | 0 | -27204 | gtex_brain_putamen_basal |
RS17606268 | 4 | 37801163 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 2.172E-9 | 0 | -27092 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11737776 | 4 | 37801348 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 2.172E-9 | 0 | -26907 | gtex_brain_putamen_basal |
RS398107204 | 4 | 37801666 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 5.128e-10 | 0 | -26589 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6832381 | 4 | 37801922 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 2.173E-9 | 0 | -26333 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6849324 | 4 | 37801952 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 2.172E-9 | 0 | -26303 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11938059 | 4 | 37802139 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.188E-8 | 0 | -26116 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6849750 | 4 | 37802141 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.187E-8 | 0 | -26114 | gtex_brain_putamen_basal |
RS112691053 | 4 | 37802449 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 5.889E-9 | 0 | -25806 | gtex_brain_putamen_basal |
RS76792647 | 4 | 37802625 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 5.949E-9 | 0 | -25630 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13103553 | 4 | 37802850 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 5.908E-9 | 0 | -25405 | gtex_brain_putamen_basal |
RS34371555 | 4 | 37802906 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 2.172E-9 | 0 | -25349 | gtex_brain_putamen_basal |
RS34274238 | 4 | 37802988 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 2.147E-9 | 0 | -25267 | gtex_brain_putamen_basal |
RS34856096 | 4 | 37803052 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 2.172E-9 | 0 | -25203 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13110103 | 4 | 37803233 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 2.172E-9 | 0 | -25022 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1425322 | 4 | 37803423 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 2.172E-9 | 0 | -24832 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1834340 | 4 | 37803601 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 2.172E-9 | 0 | -24654 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1863283 | 4 | 37803619 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 9.43e-9 | 0 | -24636 | gtex_brain_putamen_basal |
RS5857588 | 4 | 37803623 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 9.373E-9 | 0 | -24632 | gtex_brain_putamen_basal |
RS883270 | 4 | 37803934 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 2.172E-9 | 0 | -24321 | gtex_brain_putamen_basal |
RS35923894 | 4 | 37804347 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 2.29e-6 | 0 | -23908 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1425321 | 4 | 37804819 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 9.43e-9 | 0 | -23436 | gtex_brain_putamen_basal |
RS56838577 | 4 | 37807521 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 4.54e-9 | 0 | -20734 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12499691 | 4 | 37807681 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 5.339E-9 | 0 | -20574 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4832955 | 4 | 37809773 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 6.589E-9 | 0 | -18482 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1834345 | 4 | 37810182 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.644E-6 | 0 | -18073 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4832737 | 4 | 37812202 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 5.942e-9 | 0 | -16053 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4832738 | 4 | 37814993 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 5.477E-9 | 0 | -13262 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7691795 | 4 | 37816597 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 5.314e-9 | 0 | -11658 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4832956 | 4 | 37816879 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 5.294E-9 | 0 | -11376 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12512677 | 4 | 37817932 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 3.319E-9 | 0 | -10323 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1115683 | 4 | 37820396 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 3.417E-9 | 0 | -7859 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2911917 | 4 | 37820533 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.495E-6 | 0 | -7722 | gtex_brain_putamen_basal |
RS34738612 | 4 | 37821794 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.244e-8 | 0 | -6461 | gtex_brain_putamen_basal |
RS35282905 | 4 | 37821847 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 4.401E-10 | 0 | -6408 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2911910 | 4 | 37822075 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.391E-6 | 0 | -6180 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11721535 | 4 | 37824325 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 3.401E-9 | 0 | -3930 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3775798 | 4 | 37824855 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 3.598E-9 | 0 | -3400 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3756142 | 4 | 37825550 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 3.44e-9 | 0 | -2705 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4832957 | 4 | 37825940 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 3.44e-9 | 0 | -2315 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13122762 | 4 | 37826536 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 3.409E-9 | 0 | -1719 | gtex_brain_putamen_basal |
RS59397780 | 4 | 37827578 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 3.413E-9 | 0 | -677 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2059483 | 4 | 37828186 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 4.615E-8 | 0 | -69 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3775796 | 4 | 37830358 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 3.261E-9 | 0 | 2103 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11733779 | 4 | 37833060 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 3.44e-9 | 0 | 4805 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3775793 | 4 | 37840606 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 3.44e-9 | 0 | 12351 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3775792 | 4 | 37840653 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 3.44e-9 | 0 | 12398 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12501402 | 4 | 37844504 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 3.447E-9 | 0 | 16249 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12509391 | 4 | 37844604 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 3.447E-9 | 0 | 16349 | gtex_brain_putamen_basal |
RS398107206 | 4 | 37845833 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 9.457E-9 | 0 | 17578 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13128974 | 4 | 37848085 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 3.44e-9 | 0 | 19830 | gtex_brain_putamen_basal |
RS35704131 | 4 | 37850312 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 3.448e-9 | 0 | 22057 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4832959 | 4 | 37852564 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 3.155e-9 | 0 | 24309 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6820161 | 4 | 37853172 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.043E-8 | 0 | 24917 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6838455 | 4 | 37853243 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.043E-8 | 0 | 24988 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6820375 | 4 | 37853268 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.046E-8 | 0 | 25013 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6820384 | 4 | 37853286 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.046E-8 | 0 | 25031 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13146036 | 4 | 37853375 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.043E-8 | 0 | 25120 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13114137 | 4 | 37853392 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.043E-8 | 0 | 25137 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13140704 | 4 | 37853407 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.033E-8 | 0 | 25152 | gtex_brain_putamen_basal |
RS35619511 | 4 | 37853557 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.043E-8 | 0 | 25302 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6842833 | 4 | 37853661 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.043E-8 | 0 | 25406 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4832960 | 4 | 37854182 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.043E-8 | 0 | 25927 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4832961 | 4 | 37854327 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.043E-8 | 0 | 26072 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6531582 | 4 | 37854607 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.043E-8 | 0 | 26352 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6531583 | 4 | 37854693 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.043E-8 | 0 | 26438 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6531584 | 4 | 37854756 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.043E-8 | 0 | 26501 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6531585 | 4 | 37854827 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.043E-8 | 0 | 26572 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6531586 | 4 | 37854849 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.046E-8 | 0 | 26594 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6531587 | 4 | 37854911 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.046E-8 | 0 | 26656 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6827984 | 4 | 37854920 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.046E-8 | 0 | 26665 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11730888 | 4 | 37855550 | PGM2 | ENSG00000169299.9 | 1.334E-8 | 0 | 27295 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PGM2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG糖酵解糖异生 | 62 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG戊糖磷酸盐途径 | 27 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg银乳糖代谢 | 26 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg淀粉和蔗糖代谢 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG氨基糖和核苷酸糖代谢 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome糖原分解糖原分解 | 18 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
碳水化合物的反应组代谢 | 247 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组葡萄糖代谢 | 69 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM2 | 153 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Goldrath抗原反应 | 346 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Core血清反应 | 212 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李最近的胸腺移民 | 227 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |