基因页面:TBC1D2
总结吗?
| GeneID | 55357年 |
| 象征 | TBC1D2 |
| 同义词 | PARIS-1 | PARIS1 | TBC1D2A |
| 描述 | TBC1域家庭成员2 |
| 参考 | MIM: 609871|HGNC: HGNC: 18026|运用:ENSG00000095383|织女:OTTHUMG00000020343 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 9 q22.33 |
| 帕斯卡假定值 | 0.004 |
| 胎儿β | -0.138 |
| eGene | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 海马体 下丘脑 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs10985366 | 9 | 100954077 | TBC1D2 | ENSG00000095383.15 | 1.559 e-6 | 0.01 | 63838年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3780450 | 9 | 100965008 | TBC1D2 | ENSG00000095383.15 | 1.14 e-6 | 0.01 | 52907年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3780449 | 9 | 100965307 | TBC1D2 | ENSG00000095383.15 | 1.316 e-6 | 0.01 | 52608年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3739667 | 9 | 100965472 | TBC1D2 | ENSG00000095383.15 | 2.42 e-6 | 0.01 | 52443年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10985441 | 9 | 100970881 | TBC1D2 | ENSG00000095383.15 | 1.134 e-6 | 0.01 | 47034年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3739666 | 9 | 100971348 | TBC1D2 | ENSG00000095383.15 | 1.134 e-6 | 0.01 | 46567年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2023361 | 9 | 100972162 | TBC1D2 | ENSG00000095383.15 | 1.237 e-6 | 0.01 | 45753年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs733040 | 9 | 100972388 | TBC1D2 | ENSG00000095383.15 | 4.989 e - | 0.01 | 45527年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs942166 | 9 | 100972699 | TBC1D2 | ENSG00000095383.15 | 1.628 e-6 | 0.01 | 45216年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4743186 | 9 | 100976086 | TBC1D2 | ENSG00000095383.15 | 1.628 e-6 | 0.01 | 41829年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2417893 | 9 | 100977392 | TBC1D2 | ENSG00000095383.15 | 1.628 e-6 | 0.01 | 40523年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2900463 | 9 | 100977457 | TBC1D2 | ENSG00000095383.15 | 1.628 e-6 | 0.01 | 40458年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7021760 | 9 | 100978294 | TBC1D2 | ENSG00000095383.15 | 1.628 e-6 | 0.01 | 39621年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3739665 | 9 | 100979343 | TBC1D2 | ENSG00000095383.15 | 1.628 e-6 | 0.01 | 38572年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3739664 | 9 | 100979345 | TBC1D2 | ENSG00000095383.15 | 1.628 e-6 | 0.01 | 38570年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7855855 | 9 | 100983566 | TBC1D2 | ENSG00000095383.15 | 6.517 e - | 0.01 | 34349年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人DN | 463年 | 290年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 周炎症反应生活的DN | 384年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日WT1目标8小时 | 164年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日WT1目标12小时 | 162年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN GOZGIT ESR1目标 | 781年 | 465年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布伊泰尔特说光动力治疗压力DN | 637年 | 377年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼转移DN | 261年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 小山SEMA3B目标了 | 292年 | 168年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| AMIT EGF响应480海拉 | 164年 | 118年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CREIGHTON内分泌治疗抵抗3 | 720年 | 440年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝癌了 | 973年 | 570年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伯纳德PPAPDC1B DN的目标 | 58 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 泰勒甲基化在急性淋巴细胞白血病 | 77年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KOINUMA SMAD2或SMAD3的目标 | 824年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 促进DN KDM1A目标 | 211年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG类1引起的暂时性的EGF | 516年 | 308年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |