基因页面:TMCO6
总结吗?
| GeneID | 55374年 |
| 象征 | TMCO6 |
| 同义词 | PRO1580 |
| 描述 | 跨膜和卷曲螺旋域6 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 28814|运用:ENSG00000113119|HPRD: 15177|织女:OTTHUMG00000129497 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 5 q31.3 |
| 帕斯卡假定值 | 1.721 e-5 |
| 夏洛克假定值 | 0.197 |
| eGene | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 海马体 硬膜基底神经节 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0032 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs6867236 | 5 | 140125874 | TMCO6 | ENSG00000113119.8 | 7.19603 e-6 | 0.05 | 106862年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2563284 | 5 | 140126184 | TMCO6 | ENSG00000113119.8 | 6.75229 e-6 | 0.05 | 107172年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| DIDO1 | 0.95 | 0.94 |
| ZNF212 | 0.94 | 0.93 |
| POGK | 0.94 | 0.92 |
| C10orf2 | 0.93 | 0.91 |
| PDCD11 | 0.93 | 0.92 |
| CHD8 | 0.93 | 0.93 |
| DHX38 | 0.93 | 0.94 |
| ZNF317 | 0.93 | 0.92 |
| MTMR3 | 0.93 | 0.92 |
| PCF11 | 0.93 | 0.93 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.74 | -0.84 |
| MT-CO2 | -0.73 | -0.83 |
| FXYD1 | -0.72 | -0.80 |
| AF347015.27 | -0.72 | -0.82 |
| IFI27 | -0.72 | -0.80 |
| AF347015.21 | -0.71 | -0.88 |
| AF347015.33 | -0.70 | -0.79 |
| HIGD1B | -0.70 | -0.81 |
| C5orf53 | -0.70 | -0.71 |
| MYL3 | -0.70 | -0.80 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005488 | 绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008565 | 转运蛋白活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006606 | 蛋白导入核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006886 | 细胞内蛋白质的运输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005643 | 核孔 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| GAZDA钻石BLACKFAN贫血红细胞DN | 493年 | 298年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布伊泰尔特说光动力治疗压力DN | 637年 | 377年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 而VOXPHOS | 87年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王MLL CBP的目标融合起来 | 44 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染14小时血巨细胞病毒DN | 298年 | 200年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王顺铂的反应和XPC DN | 228年 | 146年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒20小时DN | 101年 | 70年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染48小时血巨细胞病毒DN | 504年 | 323年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 瑞士POSTRADIATION肿瘤逃避DN | 373年 | 196年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MASSARWEH三苯氧胺耐药性DN | 258年 | 160年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MASSARWEH应对雌二醇 | 61年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒1小时DN | 222年 | 147年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |