基因页：PPT1
Summary？
| 基因ID | 5538 |
| Symbol | PPT1 |
| 同义词 | CLN1|INCL|PPT |
| 描述 | 棕榈酰蛋白硫酯酶1 |
| 参考 | MIM：600722|HGNC：HGNC：9325|运用:ENSG00000131238|HPRD：07203|Vega：Otthumg00000004495 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 132 |
| Pascal P值 | 0.835 |
| Sherlock P值 | 0.316 |
| 胎儿β | -1.213 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑 元 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 11 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG19736671 | 1 | 40562678 | PPT1 | 4.55e-8 | -0.007 | 1.24e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| NECAB2 | 0.80 | 0.78 |
| CNTN6 | 0.79 | 0.65 |
| anxa3 | 0.78 | 0.53 |
| calb2 | 0.77 | 0.55 |
| EGFL6 | 0.75 | 0.53 |
| NEFL | 0.73 | 0.68 |
| DOK7 | 0.71 | 0.59 |
| OTX2 | 0.71 | -0.04 |
| TP53I3 | 0.70 | 0.08 |
| SLC17A6 | 0.69 | 0.43 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| foxg1b | -0.27 | -0.36 |
| SMTN | -0.26 | -0.53 |
| ISLR2 | -0.25 | -0.27 |
| sigirr | -0.25 | -0.43 |
| Zeb2 | -0.25 | -0.32 |
| LZTS1 | -0.24 | -0.27 |
| TTC28 | -0.24 | -0.34 |
| EMX1 | -0.24 | -0.22 |
| mpped1 | -0.24 | -0.24 |
| Neurod2 | -0.24 | -0.30 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO：0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
| 去：0008474 | 棕榈酰 - （蛋白）水解酶活性 | 艾达 | 10658183|10737604 | |
| 去：0008474 | 棕榈酰 - （蛋白）水解酶活性 | IEA | - | |
| 去：0008474 | 棕榈酰 - （蛋白）水解酶活性 | IMP | 7637805 | |
| 去：0008474 | 棕榈酰 - （蛋白）水解酶活性 | ISS | - | |
| GO：0016290 | 棕榈酰-COA水解酶活性 | 艾达 | 10658183 | |
| GO：0016290 | 棕榈酰-COA水解酶活性 | ISS | - | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007420 | 大脑发育 | IEP | 大脑（GO期限：7） | 10992246 |
| 去：0007420 | 大脑发育 | IMP | 大脑（GO期限：7） | 7637805 |
| GO：0048666 | 神经元发展 | 塔斯 | 神经元（GO期限：9） | 11136716 |
| 去：0007269 | 神经递质分泌 | IEA | neuron, axon, Synap, serotonin, Neurotransmitter, dopamine (GO term level: 8) | - |
| GO:0050803 | 调节突触结构和活动 | nas | 神经元，突触（GO期限：7） | 11136716 |
| GO：0043524 | negative regulation of neuron apoptosis | IMP | 神经元（GO期限：9） | 10737604|11020216 |
| 去：0007399 | nervous system development | IMP | 神经突（GO期限：5） | 7637805 |
| 去：0002084 | 蛋白质去氨木酰化 | 艾达 | 10658183|10737604 | |
| 去：0002084 | 蛋白质去氨木酰化 | ISS | - | |
| 去：0006309 | 凋亡期间的DNA碎片 | 艾达 | 15929065 | |
| GO:0006464 | 蛋白质修饰过程 | IEA | - | |
| GO:0016042 | 脂质分解代谢过程 | 艾达 | 8816748 | |
| 去：0007042 | lysosomal lumen acidification | IMP | 11722572 | |
| 去：0008306 | 协会学习 | IEA | - | |
| 去：0008344 | 成人运动行为 | IEA | - | |
| 去：0007625 | 修饰行为 | IEA | - | |
| 去：0007601 | 视觉感知 | IEA | - | |
| 去：0015031 | 蛋白质运输 | IMP | 10737604 | |
| GO：0050896 | response to stimulus | IEA | - | |
| GO：0051181 | 辅因子运输 | IMP | 16542649 | |
| GO：0051186 | 辅因子代谢过程 | IMP | 16542649 | |
| GO：0048260 | positive regulation of receptor-mediated endocytosis | IMP | 16542649 | |
| GO：0031579 | 膜筏组织 | IMP | 15929065 | |
| GO：0030149 | 鞘脂分解代谢过程 | 塔斯 | 16542649 | |
| 去：0030308 | 细胞生长的负调控 | IMP | 10737604 | |
| GO：0032429 | 调节磷脂酶A2活性 | IEA | - | |
| GO:0044257 | cellular protein catabolic process | IEA | - | |
| GO：0048549 | 皮细胞增多症的阳性调节 | IMP | 16542649 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0043025 | 细胞体 | IEA | Axon，Dendrite（GO期限：4） | - |
| 去：0008021 | 突触囊泡 | 艾达 | 突触，神经递质（GO期限：12） | 12483688 |
| GO：0030425 | 树突 | IEA | 神经元，轴突，树突（GO期限：6） | - |
| GO：0030424 | 轴突 | 艾达 | 神经元，轴突，神经递质（GO期限：6） | 12483688 |
| 去：0005794 | 高尔基体 | 艾达 | 7637805 | |
| 去：0005829 | 细胞质 | ISS | - | |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | 艾达 | 8895569 | |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | ISS | - | |
| 去：0005615 | 细胞外空间 | IEA | - | |
| 去：0005624 | 膜分数 | ISS | - | |
| 去：0005634 | 核 | 艾达 | 10992246 | |
| 去：0005764 | 溶酶体 | 艾达 | 8895569|11020216 | |
| 去：0005764 | 溶酶体 | ISS | - | |
| GO:0045121 | 膜筏 | 艾达 | 15929065 |