基因页:准备
概括?
基因 | 5550 |
象征 | 准备 |
同义词 | pe | pep |
描述 | 脯氨酰内肽酶 |
参考 | MIM:600400|HGNC:HGNC:9358|Ensembl:ENSG00000085377|HPRD:02673|Vega:Otthumg0000000015297 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q22 |
Pascal P值 | 0.113 |
Sherlock P值 | 0.144 |
胎儿β | -0.035 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PREP_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
rasal1 | 0.86 | 0.86 |
TMEM130 | 0.86 | 0.89 |
CPNE6 | 0.86 | 0.89 |
SUSD4 | 0.86 | 0.87 |
Mink1 | 0.84 | 0.80 |
MAP2K1 | 0.84 | 0.85 |
AP001107.1 | 0.83 | 0.87 |
ptprn | 0.82 | 0.89 |
ZNF831 | 0.81 | 0.78 |
TTC7B | 0.81 | 0.87 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RBMX2 | -0.50 | -0.60 |
Bcl7c | -0.49 | -0.60 |
tubb2b | -0.49 | -0.48 |
KIAA1949 | -0.49 | -0.37 |
traf4 | -0.49 | -0.53 |
SH3BP2 | -0.47 | -0.51 |
RPL23A | -0.47 | -0.54 |
Dynlt1 | -0.47 | -0.57 |
carhsp1 | -0.47 | -0.53 |
exosc8 | -0.47 | -0.45 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004252 | 丝氨酸型内肽酶活性 | IEA | 谷氨酸(GO期限:7) | - |
去:0004252 | 丝氨酸型内肽酶活性 | 塔斯 | 谷氨酸(GO期限:7) | 9695945 |
去:0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解 | IEA | - | |
去:0006508 | 蛋白水解 | 塔斯 | 9695945 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 9695945 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Doane对雄激素的反应 | 184 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bogni治疗与髓样白血病DN有关 | 33 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wamunyokoli卵巢癌LMP | 265 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与基础 | 330 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCIAN反转TP53和TP73 DN的目标 | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori未成熟B淋巴细胞DN | 90 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori成熟B淋巴细胞DN | 75 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江龄大脑皮层 | 36 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C4的反应 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江式下丘脑老化 | 47 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与11q23重新排列 | 351 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dang myc的目标 | 143 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应14 | 143 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rampon丰富学习环境早期DN | 10 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Karlsson TGFB1靶向 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-455 | 212 | 218 | M8 | HSA-MIR-455 | Uaugugccuuuggacuacaucg |