概括
基因 5550
象征 准备
同义词 pe | pep
描述 脯氨酰内肽酶
参考 MIM:600400|HGNC:HGNC:9358|Ensembl:ENSG00000085377|HPRD:02673|Vega:Otthumg0000000015297
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q22
Pascal P值 0.113
Sherlock P值 0.144
胎儿β -0.035
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
rasal1 0.86 0.86
TMEM130 0.86 0.89
CPNE6 0.86 0.89
SUSD4 0.86 0.87
Mink1 0.84 0.80
MAP2K1 0.84 0.85
AP001107.1 0.83 0.87
ptprn 0.82 0.89
ZNF831 0.81 0.78
TTC7B 0.81 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RBMX2 -0.50 -0.60
Bcl7c -0.49 -0.60
tubb2b -0.49 -0.48
KIAA1949 -0.49 -0.37
traf4 -0.49 -0.53
SH3BP2 -0.47 -0.51
RPL23A -0.47 -0.54
Dynlt1 -0.47 -0.57
carhsp1 -0.47 -0.53
exosc8 -0.47 -0.45

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004252 丝氨酸型内肽酶活性 IEA 谷氨酸(GO期限:7) -
去:0004252 丝氨酸型内肽酶活性 塔斯 谷氨酸(GO期限:7) 9695945
去:0008233 肽酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006508 蛋白水解 IEA -
去:0006508 蛋白水解 塔斯 9695945
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0005737 细胞质 塔斯 9695945

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Doane对雄激素的反应 184 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bogni治疗与髓样白血病DN有关 33 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌LMP 265 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCIAN反转TP53和TP73 DN的目标 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori未成熟B淋巴细胞DN 90 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori成熟B淋巴细胞DN 75 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江龄大脑皮层 36 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C4的反应 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江式下丘脑老化 47 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dang myc的目标 143 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应14 143 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rampon丰富学习环境早期DN 10 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-455 212 218 M8 HSA-MIR-455 Uaugugccuuuggacuacaucg