基因页:TNFRSF19
概括?
基因 | 55504 |
象征 | TNFRSF19 |
同义词 | 泰姬陵|塔吉 - 阿尔法|贸易|特洛伊 |
描述 | 肿瘤坏死因子受体超家族成员19 |
参考 | MIM:606122|HGNC:HGNC:11915|ENSEMBL:ENSG00000127863|HPRD:05838|Vega:Otthumg0000000016568 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 13Q12.11-Q12.3 |
Pascal P值 | 0.913 |
胎儿β | 1.832 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
简历:Phewas | 全球整个关联研究(PHEWAS) | 157个与精神分裂症相关的SNP | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:Phewas
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1572072 | 13 | 24127210 | 无效的 | 1.498 | TNFRSF19 | 无效的 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TNFRSF19_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SIGMAR1 | 0.82 | 0.80 |
CPSF3L | 0.82 | 0.82 |
toe1 | 0.81 | 0.80 |
SLC35B2 | 0.81 | 0.80 |
CCDC71 | 0.80 | 0.82 |
ADPRHL2 | 0.80 | 0.80 |
MAP3K7IP1 | 0.80 | 0.79 |
CD151 | 0.80 | 0.76 |
UNC45A | 0.80 | 0.76 |
DVL2 | 0.80 | 0.79 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.61 | -0.68 |
AF347015.31 | -0.60 | -0.66 |
MT-CO2 | -0.58 | -0.65 |
mt-cyb | -0.58 | -0.65 |
AF347015.33 | -0.58 | -0.63 |
AF347015.8 | -0.57 | -0.65 |
AF347015.15 | -0.56 | -0.65 |
AF347015.2 | -0.54 | -0.62 |
AF347015.21 | -0.53 | -0.69 |
AF347015.26 | -0.52 | -0.62 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Corre多发性骨髓瘤DN | 62 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 | 170 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 | 165 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cervera SDHB目标2 | 114 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CERVERA SDHB靶向1个 | 118 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标 | 126 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Traynor Rett综合征 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
safford t淋巴细胞厌食 | 87 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克道尔急性肺损伤DN | 48 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Marson Foxp3目标刺激了 | 29 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标 | 212 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom Wnt途径需要MYC | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yauch刺猬信号传导旁分泌 | 149 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ju Aging TERC靶向 | 10 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类干扰素DN | 52 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇6的时间反应6 | 75 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1不是通过AKT1 DN的目标 | 88 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 | 229 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasini suz12靶向DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kasler HDAC7目标2 DN | 32 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja肝HNF1A靶向 | 135 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 | 275 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |