概括
基因 55504
象征 TNFRSF19
同义词 泰姬陵|塔吉 - 阿尔法|贸易|特洛伊
描述 肿瘤坏死因子受体超家族成员19
参考 MIM:606122|HGNC:HGNC:11915|ENSEMBL:ENSG00000127863|HPRD:05838|Vega:Otthumg0000000016568
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q12.11-Q12.3
Pascal P值 0.913
胎儿β 1.832

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历:Phewas 全球整个关联研究(PHEWAS) 157个与精神分裂症相关的SNP 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:Phewas

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS1572072 13 24127210 无效的 1.498 TNFRSF19 无效的


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SIGMAR1 0.82 0.80
CPSF3L 0.82 0.82
toe1 0.81 0.80
SLC35B2 0.81 0.80
CCDC71 0.80 0.82
ADPRHL2 0.80 0.80
MAP3K7IP1 0.80 0.79
CD151 0.80 0.76
UNC45A 0.80 0.76
DVL2 0.80 0.79
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.61 -0.68
AF347015.31 -0.60 -0.66
MT-CO2 -0.58 -0.65
mt-cyb -0.58 -0.65
AF347015.33 -0.58 -0.63
AF347015.8 -0.57 -0.65
AF347015.15 -0.56 -0.65
AF347015.2 -0.54 -0.62
AF347015.21 -0.53 -0.69
AF347015.26 -0.52 -0.62

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 267 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Corre多发性骨髓瘤DN 62 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 170 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 165 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cervera SDHB目标2 114 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CERVERA SDHB靶向1个 118 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 126 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Traynor Rett综合征 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
safford t淋巴细胞厌食 87 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克道尔急性肺损伤DN 48 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Marson Foxp3目标刺激了 29 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 212 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom Wnt途径需要MYC 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ju Aging TERC靶向 10 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 UP 176 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类干扰素DN 52 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇6的时间反应6 75 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1不是通过AKT1 DN的目标 88 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 229 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kasler HDAC7目标2 DN 32 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向 135 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 275 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因