基因页：BATF3
概括？
| 基因 | 55509 |
| 象征 | BATF3 |
| 同义词 | jdp1 | jundm1 | snft |
| 描述 | 基本亮氨酸拉链类ATF样转录因子3 |
| 参考 | MIM：612470|HGNC：HGNC：28915|ENSEMBL：ENSG00000123685|HPRD：18081|Vega：Otthumg0000000036807 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q32.3 |
| Sherlock P值 | 0.097 |
| 胎儿β | -1.601 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 皮质 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG06150468 | 1 | 212874085 | BATF3 | 5.35e-9 | -0.018 | 2.97E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS12128789 | CHR1 | 212852831 | BATF3 | 55509 | 0.01 | 顺式 | ||
| RS7655225 | CHR4 | 170265627 | BATF3 | 55509 | 0.11 | 反式 | ||
| SNP_A-2211190 | 0 | BATF3 | 55509 | 0.16 | 反式 | |||
| RS1829763 | Chr11 | 80749449 | BATF3 | 55509 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PDAP1 | 0.87 | 0.88 |
| acin1 | 0.87 | 0.85 |
| Luc7l | 0.86 | 0.88 |
| SNRPD3 | 0.86 | 0.87 |
| DNAJC17 | 0.86 | 0.87 |
| C18orf22 | 0.85 | 0.88 |
| C1orf35 | 0.84 | 0.79 |
| grk4 | 0.84 | 0.86 |
| 纳格 | 0.84 | 0.86 |
| ODF2 | 0.84 | 0.86 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.27 | -0.70 | -0.78 |
| AF347015.31 | -0.70 | -0.78 |
| MT-CO2 | -0.68 | -0.75 |
| mt-cyb | -0.67 | -0.76 |
| AF347015.33 | -0.67 | -0.75 |
| AF347015.8 | -0.65 | -0.75 |
| AF347015.15 | -0.64 | -0.75 |
| AF347015.2 | -0.64 | -0.77 |
| HLA-F | -0.62 | -0.65 |
| AF347015.9 | -0.62 | -0.74 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| pid nfat tfpathway | 47 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID TCR钙途径 | 29 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 | 194 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过小径dn | 186 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche皮肤肿瘤启动子 | 142 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险低DN | 165 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险高 | 147 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| darwiche鳞状细胞癌DN | 181 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤CD1 | 45 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HU遗传毒性损伤24小时 | 35 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 冬季缺氧metagene | 242 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Goldrath抗原反应 | 346 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF DN的响应 | 235 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF与CSF2RB和IL4 DN的响应 | 245 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| li诱导了自然杀手 | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wierenga Stat5A靶向 | 217 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wierenga Stat5a Targets Group1 | 136 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |