基因页：FEM1A
概括？
| 基因 | 55527 |
| 象征 | FEM1A |
| 同义词 | EPRAP |
| 描述 | FEM-1同源物A（秀丽隐杆线虫） |
| 参考 | MIM：613538|HGNC：HGNC：16934|HPRD：16888| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19p13.3 |
| Pascal P值 | 0.329 |
| 胎儿β | -0.516 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG26336164 | 19 | 4791680 | FEM1A | -0.022 | 0.65 | DMG：Nishioka_2013 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7252762 | 19 | 4797319 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 1.156E-7 | 0.01 | 5591 | gtex_brain_ba24 |
| RS4807641 | 19 | 4787763 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 4.009E-7 | 0 | -3965 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12609188 | 19 | 4788791 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 8.63e-8 | 0 | -2937 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11085099 | 19 | 4794257 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 1.727E-7 | 0 | 2529 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS201690682 | 19 | 4794946 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 3.074e-8 | 0 | 3218 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS201811248 | 19 | 4794947 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 3.122e-8 | 0 | 3219 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS8111933 | 19 | 4795647 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 3.519E-9 | 0 | 3919 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7252762 | 19 | 4797319 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 6.87E-9 | 0 | 5591 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62113934 | 19 | 4801859 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 9.523e-8 | 0 | 10131 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS143319456 | 19 | 4802424 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 4.81E-9 | 0 | 10696 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62113935 | 19 | 4802542 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 2.022e-7 | 0 | 10814 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS8113352 | 19 | 4804212 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 2.075E-7 | 0 | 12484 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS8102626 | 19 | 4804524 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 4.834e-7 | 0 | 12796 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS75348862 | 19 | 4805003 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 4.959E-7 | 0 | 13275 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62113936 | 19 | 4805095 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 5.131E-7 | 0 | 13367 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7253085 | 19 | 4806381 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 1.089E-6 | 0 | 14653 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62113939 | 19 | 4806705 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 1.008e-6 | 0 | 14977 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62113940 | 19 | 4807247 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 9.553E-7 | 0 | 15519 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS8110678 | 19 | 4807893 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 9.365e-7 | 0 | 16165 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS8100815 | 19 | 4808305 | FEM1A | ENSG00000141965.3 | 4.453E-7 | 0 | 16577 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| arvcf | 0.91 | 0.88 |
| PRR14 | 0.91 | 0.88 |
| Med25 | 0.91 | 0.88 |
| ZNF446 | 0.90 | 0.90 |
| ralgds | 0.90 | 0.88 |
| Telo2 | 0.89 | 0.87 |
| gramd1a | 0.89 | 0.84 |
| 威兹 | 0.89 | 0.87 |
| tor2a | 0.89 | 0.85 |
| KIAA1602 | 0.89 | 0.89 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C5orf53 | -0.70 | -0.70 |
| ACOT13 | -0.66 | -0.68 |
| AF347015.27 | -0.66 | -0.73 |
| S100B | -0.64 | -0.69 |
| AF347015.31 | -0.64 | -0.72 |
| MT-CO2 | -0.62 | -0.72 |
| AF347015.21 | -0.61 | -0.79 |
| AF347015.33 | -0.60 | -0.68 |
| EAF2 | -0.60 | -0.66 |
| AF347015.8 | -0.60 | -0.71 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Bidus转移 | 214 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vietor ifrd1目标 | 23 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Cheng由雌二醇印记 | 110 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |