Summary
基因ID 55568
象征 galnt10
同义词 galnact10 | ppgalnact10 | ppgantase10
描述 多肽N-乙酰乳糖酰氨基转移酶10
参考 MIM:608043|HGNC:HGNC:19873|ENSEMBL:ENSG00000164574|HPRD:12157|Vega:Otthumg00000130145
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5q33.2
Pascal P值 3.968e-8
胎儿β 0.758
主持人 小脑半球
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0032
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01718
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00459

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
rs11740474 CHR5 153680747 3.936E-8 内含子 galnt10


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005529 糖结合 IEA -
去:0005509 钙离子结合 IEA -
去:0004653 多肽N-乙酰乳糖酰氨基转移酶活性 IEA -
GO:0016757 转移酶活动,转移glycosyl groups IEA -
GO:0030145 manganese ion binding IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006493 蛋白氨基酸O连接糖基化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000139 高尔基膜 IEA -
去:0005794 高尔基体 IEA -
GO:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg o glycan生物合成 30 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组o粘蛋白的糖基化 59 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome术后翻译蛋白修饰 188 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAVICIONI TARGETS OF PAX FOXO1 FUSIONS UP 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
roversi神经胶质瘤副本编号 100 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mattioli多发性骨髓瘤,有14q32易位 36 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由EWS FLT1融合绑定的Siligan 47 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 382 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化中等程度与不良 121 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2向上 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过CTNNB1发出的CDH1信号传导 83 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 212 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标需要MYC 210 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mirlet7a3 DN的Brueckner目标 78 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bohn原发性免疫缺陷综合症DN 40 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wagner Apo2敏感性 25 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kobayashi EGFR信令24小时DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时DN 91 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 DN目标 82 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Pten的目标 18 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124/506 2072 2078 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-26 2055 2061 1a HSA-MIR-26A Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu