基因页面:FOXRED1
总结吗?
| GeneID | 55572年 |
| 象征 | FOXRED1 |
| 同义词 | FP634 | H17 |
| 描述 | FAD-dependent氧化还原酶域包含1 |
| 参考 | MIM: 613622|HGNC: HGNC: 26927|运用:ENSG00000110074|HPRD: 13620|织女:OTTHUMG00000165827 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 11 q24.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.031 |
| 夏洛克假定值 | 0.92 |
| 胎儿β | -0.568 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 下丘脑 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 元 |
| 支持 | CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
| 认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| FOXRED1 | chr11 | 126141344 | 一个 | G | NM_017547 NR_037647 NR_037648 |
p.33K > R 。 。 |
错义 intronic npcRNA |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
不同甲基化基因
| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg01991383 | 11 | 126139007 | FOXRED1 | 3.69 e-9 | -0.011 | 2.36 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs1946064 | chr11 | 126727946 | FOXRED1 | 55572年 | 0.14 | 独联体 | ||
| rs7947480 | chr11 | 126735192 | FOXRED1 | 55572年 | 0.15 | 独联体 | ||
| rs574198 | 11 | 126069841 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 4.348 e - | 0.02 | -71491年 | gtex_brain_ba24 |
| rs492154 | 11 | 126070614 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 9.55 e - | 0.02 | -70718年 | gtex_brain_ba24 |
| rs627911 | 11 | 126072688 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.013 e-6 | 0.02 | -68644年 | gtex_brain_ba24 |
| rs676982 | 11 | 126075219 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.012 e-6 | 0.02 | -66113年 | gtex_brain_ba24 |
| rs631372 | 11 | 126078501 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.012 e-6 | 0.02 | -62831年 | gtex_brain_ba24 |
| rs608367 | 11 | 126080757 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.035 e-6 | 0.02 | -60575年 | gtex_brain_ba24 |
| rs587891 | 11 | 126081336 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 4.493 e - | 0.02 | -59996年 | gtex_brain_ba24 |
| rs624590 | 11 | 126083337 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.034 e-6 | 0.02 | -57995年 | gtex_brain_ba24 |
| rs599647 | 11 | 126085031 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.034 e-6 | 0.02 | -56301年 | gtex_brain_ba24 |
| rs633607 | 11 | 126086768 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 4.493 e - | 0.02 | -54564年 | gtex_brain_ba24 |
| rs595660 | 11 | 126087038 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.034 e-6 | 0.02 | -54294年 | gtex_brain_ba24 |
| rs583093 | 11 | 126091557 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.034 e-6 | 0.02 | -49775年 | gtex_brain_ba24 |
| rs12293354 | 11 | 126093098 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 4.493 e - | 0.02 | -48234年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10790794 | 11 | 126093217 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 4.493 e - | 0.02 | -48115年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10790795 | 11 | 126095567 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.034 e-6 | 0.02 | -45765年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10893488 | 11 | 126095747 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 4.493 e - | 0.02 | -45585年 | gtex_brain_ba24 |
| rs635413 | 11 | 126099387 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.033 e-6 | 0.02 | -41945年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1815820 | 11 | 126111520 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 4.493 e - | 0.02 | -29812年 | gtex_brain_ba24 |
| rs642137 | 11 | 126114630 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 4.493 e - | 0.02 | -26702年 | gtex_brain_ba24 |
| rs538248 | 11 | 126129103 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.034 e-6 | 0.02 | -12229年 | gtex_brain_ba24 |
| rs631023 | 11 | 126129150 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.525 e-6 | 0.02 | -12182年 | gtex_brain_ba24 |
| rs685409 | 11 | 126130232 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 4.493 e - | 0.02 | -11100年 | gtex_brain_ba24 |
| rs638766 | 11 | 126134698 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.034 e-6 | 0.02 | -6634年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1786702 | 11 | 126139100 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.034 e-6 | 0.02 | -2232年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1786703 | 11 | 126139313 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 6.832 e - | 0.02 | -2019年 | gtex_brain_ba24 |
| rs634696 | 11 | 126140354 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.034 e-6 | 0.02 | -978年 | gtex_brain_ba24 |
| rs478309 | 11 | 126140468 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.034 e-6 | 0.02 | -864年 | gtex_brain_ba24 |
| rs591163 | 11 | 126148432 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.045 e-6 | 0.02 | 7100年 | gtex_brain_ba24 |
| rs672908 | 11 | 126149651 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.134 e-6 | 0.02 | 8319年 | gtex_brain_ba24 |
| rs635686 | 11 | 126180999 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.119 e-6 | 0.02 | 39667年 | gtex_brain_ba24 |
| rs686305 | 11 | 126187769 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 7.128 e - | 0.02 | 46437年 | gtex_brain_ba24 |
| rs530587 | 11 | 126064439 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 4.916 e - | 0 | -76893年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs493083 | 11 | 126065861 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 3.654 e - | 0 | -75471年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs557206 | 11 | 126065954 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 4.192 e - | 0 | -75378年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs549006 | 11 | 126067099 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 8.032 e - | 0 | -74233年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs686747 | 11 | 126067245 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 3.504 e - | 0 | -74087年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs591073 | 11 | 126067719 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 2.869 e - | 0 | -73613年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs604546 | 11 | 126068354 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 2.308 e - | 0 | -72978年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs693789 | 11 | 126068642 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.305 e - | 0 | -72690年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs574198 | 11 | 126069841 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 9.796 e-8 | 0 | -71491年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs492154 | 11 | 126070614 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 9.587 e - | 0 | -70718年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs627911 | 11 | 126072688 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 8.628 e - | 0 | -68644年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs676982 | 11 | 126075219 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 8.633 e - | 0 | -66113年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs659551 | 11 | 126076824 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 2.109 e-6 | 0 | -64508年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs631372 | 11 | 126078501 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 8.683 e - | 0 | -62831年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs608367 | 11 | 126080757 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 7.747 e - | 0 | -60575年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs587891 | 11 | 126081336 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 8.467 e-8 | 0 | -59996年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs624590 | 11 | 126083337 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 7.924 e - | 0 | -57995年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs599647 | 11 | 126085031 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 7.924 e - | 0 | -56301年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs633607 | 11 | 126086768 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 8.467 e-8 | 0 | -54564年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs595660 | 11 | 126087038 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 7.924 e - | 0 | -54294年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs583093 | 11 | 126091557 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 7.924 e - | 0 | -49775年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12293354 | 11 | 126093098 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 8.467 e-8 | 0 | -48234年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10790794 | 11 | 126093217 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 8.467 e-8 | 0 | -48115年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10790795 | 11 | 126095567 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 7.924 e - | 0 | -45765年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10893488 | 11 | 126095747 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 8.481 e-8 | 0 | -45585年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs635413 | 11 | 126099387 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 2.802 e - | 0 | -41945年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs675412 | 11 | 126103368 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.889 e-6 | 0 | -37964年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1815820 | 11 | 126111520 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 8.544 e-8 | 0 | -29812年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs642137 | 11 | 126114630 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 8.54 e-8 | 0 | -26702年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs538248 | 11 | 126129103 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 7.924 e - | 0 | -12229年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs631023 | 11 | 126129150 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 7.36 e-8 | 0 | -12182年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs685409 | 11 | 126130232 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 8.467 e-8 | 0 | -11100年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs638766 | 11 | 126134698 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 7.924 e - | 0 | -6634年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1786702 | 11 | 126139100 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 7.924 e - | 0 | -2232年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1786703 | 11 | 126139313 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 6.813 e - | 0 | -2019年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs634696 | 11 | 126140354 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 7.762 e - | 0 | -978年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs478309 | 11 | 126140468 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 7.743 e - | 0 | -864年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs591163 | 11 | 126148432 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 6.579 e - | 0 | 7100年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs672908 | 11 | 126149651 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 5.425 e - | 0 | 8319年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs8177347 | 11 | 126151761 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 3.808 e - | 0 | 10429年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs8177348 | 11 | 126153179 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.443 e-6 | 0 | 11847年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs614700 | 11 | 126161490 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 3.519 e - | 0 | 20158年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs609634 | 11 | 126163124 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.223 e - | 0 | 21792年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs611953 | 11 | 126163691 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.696 e - | 0 | 22359年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs625413 | 11 | 126164349 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 2.996 e-8 | 0 | 23017年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1695741 | 11 | 126166577 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 2.522 e - | 0 | 25245年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs8177386 | 11 | 126167135 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 3.934 e - | 0 | 25803年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs682991 | 11 | 126167696 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 4.008 e-8 | 0 | 26364年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2962117 | 11 | 126168362 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 9.391 e - | 0 | 27030年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2962116 | 11 | 126169009 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 2.18 e - | 0 | 27677年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs637462 | 11 | 126176578 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 9.302 e - | 0 | 35246年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs686305 | 11 | 126187769 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.531 e-6 | 0 | 46437年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs659456 | 11 | 126192524 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 2.019 e - | 0 | 51192年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs61524268 | 11 | 126195103 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 2.991 e - | 0 | 53771年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs603758 | 11 | 126203737 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 4.945 e - | 0 | 62405年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs593526 | 11 | 126204043 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 2.495 e - | 0 | 62711年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs582037 | 11 | 126217870 | FOXRED1 | ENSG00000110074.6 | 1.52 e-6 | 0 | 76538年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 王LMO4目标了 | 372年 | 227年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN | 800年 | 473年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 | 882年 | 572年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 道格拉斯BMI1 DN的目标 | 314年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 丰田MIR34B和MIR34C的目标 | 463年 | 262年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李BMP2 DN的目标 | 882年 | 538年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |