基因页：RNPC3
概括？
| 基因 | 55599 |
| 象征 | RNPC3 |
| 同义词 | RBM40 | RNP | SNRNP65 |
| 描述 | RNA结合区（RNP1，RRM），包含3 |
| 参考 | HGNC：HGNC：18666|ENSEMBL：ENSG00000185946|HPRD：15267|Vega：Otthumg00000166613 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1p21 |
| Pascal P值 | 0.214 |
| 胎儿β | 1.032 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG08311092 | 1 | 104068419 | RNPC3 | 2.11E-8 | -0.019 | 7.22E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
| CG24406691 | 1 | 104068664 | RNPC3 | 3.67E-8 | -0.01 | 1.06E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1862370 | CHR5 | 164911932 | RNPC3 | 55599 | 0.13 | 反式 | ||
| RS11200847 | Chr10 | 85855451 | RNPC3 | 55599 | 0.06 | 反式 | ||
| RS4366501 | Chr11 | 133380324 | RNPC3 | 55599 | 0.05 | 反式 | ||
| RS6139449 | CHR20 | 4496373 | RNPC3 | 55599 | 0.18 | 反式 | ||
| RS768323 | CHR21 | 22975883 | RNPC3 | 55599 | 0.13 | 反式 | ||
| RS6638955 | Chrx | 9684777 | RNPC3 | 55599 | 0.12 | 反式 | ||
| RS10521608 | Chrx | 10043330 | RNPC3 | 55599 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| rspry1 | 0.96 | 0.94 |
| RAF1 | 0.95 | 0.93 |
| KDM4A | 0.95 | 0.93 |
| XPO5 | 0.95 | 0.94 |
| 加特 | 0.95 | 0.93 |
| trafd1 | 0.95 | 0.91 |
| USP10 | 0.95 | 0.92 |
| EDC3 | 0.95 | 0.93 |
| ints4 | 0.95 | 0.91 |
| Med17 | 0.95 | 0.92 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.80 | -0.90 |
| AF347015.31 | -0.79 | -0.89 |
| AF347015.27 | -0.79 | -0.88 |
| AF347015.33 | -0.78 | -0.88 |
| AIFM3 | -0.77 | -0.80 |
| HLA-F | -0.77 | -0.79 |
| mt-cyb | -0.77 | -0.88 |
| AF347015.8 | -0.76 | -0.90 |
| C5orf53 | -0.75 | -0.75 |
| FXYD1 | -0.75 | -0.86 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| THUM收缩心力衰竭DN | 244 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tong与PTTG1互动 | 57 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nouzova维甲酸和H4乙酰化 | 143 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kondo EZH2目标 | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 钱德兰转移 | 221 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 惠特菲尔德细胞周期G1 S | 147 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |