基因页：ITLN1
概括？
| 基因 | 55600 |
| 象征 | ITLN1 |
| 同义词 | hl-1 | hl1 | intl | itln | lfr | hintl | omentin |
| 描述 | intelectin 1 |
| 参考 | MIM：609873|HGNC：HGNC：18259|Ensembl：ENSG00000179914|HPRD：17165|Vega：Otthumg0000000028604 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q21.3 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| 简历：Phewas | 全球整个关联研究（PHEWAS） | 157个与精神分裂症相关的SNP | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0235 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00814 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历：Phewas
简历：Phewas| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2274910 | 1 | 160852046 | 无效的 | 1.456 | ITLN1 | 无效的 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17385407 | CHR1 | 160473285 | ITLN1 | 55600 | 0.17 | 顺式 | ||
| RS16869851 | CHR4 | 20690056 | ITLN1 | 55600 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PTOV1 | 0.95 | 0.94 |
| CXXC1 | 0.94 | 0.94 |
| LRWD1 | 0.93 | 0.94 |
| CCDC94 | 0.93 | 0.93 |
| xab2 | 0.92 | 0.91 |
| Med22 | 0.92 | 0.92 |
| ZNF668 | 0.92 | 0.94 |
| tor2a | 0.92 | 0.91 |
| DGCR14 | 0.92 | 0.92 |
| DVL3 | 0.92 | 0.92 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.27 | -0.73 | -0.83 |
| AF347015.31 | -0.72 | -0.81 |
| MT-CO2 | -0.71 | -0.81 |
| AF347015.33 | -0.71 | -0.81 |
| AF347015.8 | -0.69 | -0.81 |
| C5orf53 | -0.69 | -0.72 |
| mt-cyb | -0.69 | -0.79 |
| AF347015.21 | -0.66 | -0.84 |
| AF347015.15 | -0.66 | -0.78 |
| S100B | -0.65 | -0.74 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005102 | 受体结合 | IEA | 神经递质（GO期限：4） | - |
| 去：0005529 | 糖结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0001934 | 蛋白氨基酸磷酸化的阳性调节 | 艾达 | 16531507 | |
| 去：0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
| 去：0009624 | 对线虫的响应 | ISS | - | |
| GO：0046326 | 葡萄糖进口的积极调节 | 艾达 | 16531507 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| GO：0031526 | 刷边界膜 | ISS | - | |
| GO：0031225 | 锚定在膜上 | IEA | - | |
| GO：0045121 | 膜筏 | ISS | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 肺癌吸烟者 | 80 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL顺式 | 128 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Labbe TGFB1靶向DN | 108 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈肝新陈代谢QTL顺式 | 93 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen IPS LCP带有H3K27Me3 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Baus TFF2靶向 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1和SATB1 DN的Purbey目标 | 180 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 | 308 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA ECM有关联 | 171 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |