概括
基因 55614
象征 KIF16B
同义词 C20ORF23 | KISC20ORF | SNX23
描述 动机家庭成员16B
参考 HGNC:HGNC:15869|Ensembl:ENSG00000089177|HPRD:10731|Vega:Otthumg0000000031927
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20P11.23
Pascal P值 0.002
主持人 小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TPR 0.94 0.95
DDX42 0.92 0.92
gigyf2 0.92 0.93
ythdc1 0.91 0.92
ZNF638 0.91 0.92
ZC3H13 0.91 0.93
ZNF397 0.91 0.93
USP48 0.91 0.92
ERCC5 0.91 0.91
ZC3H11A 0.90 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.75 -0.81
增强 -0.74 -0.83
ifi27 -0.74 -0.79
MT-CO2 -0.72 -0.78
AF347015.21 -0.71 -0.81
higd1b -0.71 -0.78
FXYD1 -0.70 -0.76
myl3 -0.70 -0.77
AF347015.27 -0.69 -0.75
VAMP5 -0.69 -0.77

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003777 微管运动活动 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0035091 磷酸肌醇结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007154 细胞通信 IEA -
去:0007018 基于微管的运动 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005874 微管 IEA -
去:0005875 微管相关的复合物 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Horiuchi WTAP靶向 306 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向 292 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞短期 32 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成11 57 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bredemeyer抹布通过ATM而不是通过NFKB向上发出信号 49 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 UP 167 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组D的UVC响应 280 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124/506 32 38 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-15/16/195/424/497 1115 1121 1a HSA-MIR-15A uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-221/222 899 906 1A,M8 HSA-MIR-221 agcuacauugucugugggggguc
HSA-MIR-222 agcuacaucuggcuacugggucuc
mir-30-5p 553 560 1A,M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-433-3p 599 605 M8 HSA-MIR-433 aucaugauggggcuccucggugu
mir-503 1115 1121 1a HSA-MIR-503 uagcagcgggaacaguucugcag
mir-7 611 618 1A,M8 HSA-MIR-7SZ Uggaagacuaguuuuuguug