基因页:KIF16B
概括?
基因 | 55614 |
象征 | KIF16B |
同义词 | C20ORF23 | KISC20ORF | SNX23 |
描述 | 动机家庭成员16B |
参考 | HGNC:HGNC:15869|Ensembl:ENSG00000089177|HPRD:10731|Vega:Otthumg0000000031927 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 20P11.23 |
Pascal P值 | 0.002 |
主持人 | 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KIF16B_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TPR | 0.94 | 0.95 |
DDX42 | 0.92 | 0.92 |
gigyf2 | 0.92 | 0.93 |
ythdc1 | 0.91 | 0.92 |
ZNF638 | 0.91 | 0.92 |
ZC3H13 | 0.91 | 0.93 |
ZNF397 | 0.91 | 0.93 |
USP48 | 0.91 | 0.92 |
ERCC5 | 0.91 | 0.91 |
ZC3H11A | 0.90 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.75 | -0.81 |
增强 | -0.74 | -0.83 |
ifi27 | -0.74 | -0.79 |
MT-CO2 | -0.72 | -0.78 |
AF347015.21 | -0.71 | -0.81 |
higd1b | -0.71 | -0.78 |
FXYD1 | -0.70 | -0.76 |
myl3 | -0.70 | -0.77 |
AF347015.27 | -0.69 | -0.75 |
VAMP5 | -0.69 | -0.77 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0003777 | 微管运动活动 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0035091 | 磷酸肌醇结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007154 | 细胞通信 | IEA | - | |
去:0007018 | 基于微管的运动 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005874 | 微管 | IEA | - | |
去:0005875 | 微管相关的复合物 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Horiuchi WTAP靶向 | 306 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌基础与仙女 | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向 | 292 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血干细胞短期 | 32 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成11 | 57 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bredemeyer抹布通过ATM而不是通过NFKB向上发出信号 | 49 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌ESR1 UP | 167 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-124/506 | 32 | 38 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-15/16/195/424/497 | 1115 | 1121 | 1a | HSA-MIR-15A脑 | uagcagcacauaugguugug |
HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
HSA-MIR-15B脑 | uagcagcacaucaugguuaca | ||||
HSA-MIR-195SZ | uagcagaaaaauauuggc | ||||
HSA-MIR-424 | Cagcagcaauucauguuuugaa | ||||
HSA-MIR-497 | cagcagcacacuguguuugu | ||||
mir-221/222 | 899 | 906 | 1A,M8 | HSA-MIR-221脑 | agcuacauugucugugggggguc |
HSA-MIR-222脑 | agcuacaucuggcuacugggucuc | ||||
mir-30-5p | 553 | 560 | 1A,M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
mir-433-3p | 599 | 605 | M8 | HSA-MIR-433脑 | aucaugauggggcuccucggugu |
mir-503 | 1115 | 1121 | 1a | HSA-MIR-503 | uagcagcgggaacaguucugcag |
mir-7 | 611 | 618 | 1A,M8 | HSA-MIR-7SZ | Uggaagacuaguuuuuguug |