概括
基因 55615
象征 PRR5
同义词 flj20185k | pp610 | protor-1 | protor1
描述 Proline Rich 5
参考 MIM:609406|HGNC:HGNC:31682|ENSEMBL:ENSG00000186654|HPRD:18696|Vega:Otthumg00000150460
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22Q13
Pascal P值 0.141
胎儿β 0.374
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG13757640 22 45148888 PRR5 0.003 11.635 DMG:Vaneijk_2014
CG13757640 22 45148888 PRR5 0.004 11.408 DMG:Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
sema3g 0.87 0.89
工程 0.84 0.85
SLCO2B1 0.83 0.85
vwf 0.83 0.87
TGM2 0.83 0.85
ITIH5 0.82 0.84
CD34 0.81 0.82
0.81 0.83
CDH5 0.81 0.83
SLC2A1 0.80 0.81
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Znf32 -0.62 -0.66
NDUFAF2 -0.61 -0.66
C8orf59 -0.61 -0.66
OXSM -0.59 -0.63
PPP2R3C -0.58 -0.63
FRG1 -0.58 -0.62
MTIF3 -0.58 -0.59
Commd3 -0.57 -0.60
C12orf45 -0.57 -0.63
CWC15 -0.56 -0.60

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID MTOR 4 Pathway 69 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOOI ST7靶向 94 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向 214 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向 292 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成2 72 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Burton脂肪形成峰在8小时 39 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild MYC致癌签名 206 117 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期g2 m 216 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因