基因页:PRR5
概括?
基因 | 55615 |
象征 | PRR5 |
同义词 | flj20185k | pp610 | protor-1 | protor1 |
描述 | Proline Rich 5 |
参考 | MIM:609406|HGNC:HGNC:31682|ENSEMBL:ENSG00000186654|HPRD:18696|Vega:Otthumg00000150460 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22Q13 |
Pascal P值 | 0.141 |
胎儿β | 0.374 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG13757640 | 22 | 45148888 | PRR5 | 0.003 | 11.635 | DMG:Vaneijk_2014 | |
CG13757640 | 22 | 45148888 | PRR5 | 0.004 | 11.408 | DMG:Vaneijk_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
sema3g | 0.87 | 0.89 |
工程 | 0.84 | 0.85 |
SLCO2B1 | 0.83 | 0.85 |
vwf | 0.83 | 0.87 |
TGM2 | 0.83 | 0.85 |
ITIH5 | 0.82 | 0.84 |
CD34 | 0.81 | 0.82 |
她 | 0.81 | 0.83 |
CDH5 | 0.81 | 0.83 |
SLC2A1 | 0.80 | 0.81 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Znf32 | -0.62 | -0.66 |
NDUFAF2 | -0.61 | -0.66 |
C8orf59 | -0.61 | -0.66 |
OXSM | -0.59 | -0.63 |
PPP2R3C | -0.58 | -0.63 |
FRG1 | -0.58 | -0.62 |
MTIF3 | -0.58 | -0.59 |
Commd3 | -0.57 | -0.60 |
C12orf45 | -0.57 | -0.63 |
CWC15 | -0.56 | -0.60 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID MTOR 4 Pathway | 69 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOOI ST7靶向 | 94 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向 | 214 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向 | 292 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成2 | 72 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Burton脂肪形成峰在8小时 | 39 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bild MYC致癌签名 | 206 | 117 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期g2 m | 216 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |