基因页：Stap2
概括？
| 基因 | 55620 |
| 象征 | Stap2 |
| 同义词 | BKS |
| 描述 | 信号转导适配器家族成员2 |
| 参考 | MIM：607881|HGNC：HGNC：30430|ENSEMBL：ENSG00000178078|HPRD：07430|Vega：Otthumg00000181884 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19p13.3 |
| Pascal P值 | 0.799 |
| Sherlock P值 | 0.96 |
| 胎儿β | -0.898 |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 下丘脑 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
| 支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中，通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Stap2 | CHR19 | 4338685 | 一个 | t | NM_001013841 NM_017720 |
p.22y>* p.22y>* |
废话 废话 |
精神分裂症 | DNM：XU_2012 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7258060 | CHR19 | 4332104 | Stap2 | 55620 | 1.158E-4 | 顺式 | ||
| RS7258060 | CHR19 | 4332104 | Stap2 | 55620 | 0.01 | 反式 | ||
| RS374392257 | 19 | 4331940 | Stap2 | ENSG00000178078.7 | 1.29977E-6 | 0.01 | 10843 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7258060 | 19 | 4332105 | Stap2 | ENSG00000178078.7 | 5.24181E-7 | 0.01 | 10678 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11673317 | 19 | 4332650 | Stap2 | ENSG00000178078.7 | 2.64591E-7 | 0.01 | 10133 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10413905 | 19 | 4333666 | Stap2 | ENSG00000178078.7 | 5.06307E-7 | 0.01 | 9117 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS60010631 | 19 | 4334310 | Stap2 | ENSG00000178078.7 | 5.00993E-7 | 0.01 | 8473 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS55913120 | 19 | 4334402 | Stap2 | ENSG00000178078.7 | 1.56962E-6 | 0.01 | 8381 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GAB1 | 0.84 | 0.84 |
| TRIM59 | 0.80 | 0.79 |
| jam3 | 0.80 | 0.84 |
| BBX | 0.79 | 0.84 |
| mybl1 | 0.78 | 0.84 |
| TMTC2 | 0.77 | 0.81 |
| CCNE2 | 0.76 | 0.79 |
| 9月10日 | 0.76 | 0.71 |
| 被杀1 | 0.75 | 0.66 |
| CREB5 | 0.74 | 0.84 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ST20 | -0.34 | -0.45 |
| TBC1D10A | -0.32 | -0.38 |
| PRR5 | -0.31 | -0.32 |
| Sycp3 | -0.31 | -0.37 |
| IL32 | -0.30 | -0.38 |
| RP9P | -0.30 | -0.46 |
| AC016757.1 | -0.30 | -0.35 |
| AC087071.1 | -0.30 | -0.43 |
| DUSP23 | -0.29 | -0.33 |
| emid1 | -0.29 | -0.38 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Jaeger转移DN | 258 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 冷吉非替尼抵抗DN | 230 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Scheidereit IKK相互作用蛋白 | 58 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张乳腺癌祖细胞DN | 145 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 等级转移DN | 45 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |