基因页：LRRC40
概括？
| 基因 | 55631 |
| 象征 | LRRC40 |
| 同义词 | DJ677H15.1 |
| 描述 | 亮氨酸富含40 |
| 参考 | HGNC：HGNC：26004|Ensembl：ENSG0000000066557|HPRD：08622|Vega：Otthumg00000009348 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1p31.1 |
| Pascal P值 | 0.583 |
| 胎儿β | 0.777 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.02692 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG02809263 | 1 | 70671218 | LRRC40 | 3.8e-11 | -0.01 | 3.69E-7 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ZNF252 | 0.80 | 0.83 |
| yme1l1 | 0.79 | 0.82 |
| EIF2AK4 | 0.78 | 0.80 |
| IFNAR1 | 0.78 | 0.81 |
| DHX36 | 0.78 | 0.80 |
| UTP14C | 0.78 | 0.81 |
| TMEM184C | 0.78 | 0.78 |
| C5orf51 | 0.77 | 0.82 |
| XIAP | 0.77 | 0.82 |
| Znf41 | 0.77 | 0.79 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.65 | -0.67 |
| AF347015.21 | -0.64 | -0.65 |
| MT-CO2 | -0.63 | -0.66 |
| ifi27 | -0.62 | -0.65 |
| AF347015.8 | -0.61 | -0.65 |
| higd1b | -0.61 | -0.63 |
| mt-cyb | -0.61 | -0.64 |
| AF347015.2 | -0.60 | -0.63 |
| AF347015.27 | -0.60 | -0.63 |
| AF347015.33 | -0.59 | -0.62 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003993 | 酸性磷酸酶活性 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WEI mir34a目标 | 148 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TACI DN的Moreaux多发性骨髓瘤 | 172 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chang Core血清反应 | 212 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 寄养KDM1A靶向DN | 211 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |